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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002731`

染色体: Chr02 坐标: 47227279-47232620 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002731`
名称	SmilChr02G002731
描述	small RNA degrading nuclease 5
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47227279 - 47232620 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011766`
GeneID	`131011766`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011766`
原始查询	`SmilChr02G002731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small RNA degrading nuclease 5
产物	small RNA degrading nuclease 5
Arabidopsis	`AT5G25800` (AT5G25800) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832649] identity=63.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0188900` - identity=58.8; qcov=0.746; evalue=3.97e-152; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004527 (exonuclease activity); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00929 (RNase_T)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011766

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795583.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057795585.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057795586.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057795586.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47227583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B55,C23
`Chr2:47227593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B51
`Chr2:47228074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B114,B134,B71
`Chr2:47231255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:47231705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:47231872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:47231997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795583.1

569 aa

284

569

RNase_T

PF00929 RNase_T 217-363 aa

XP_057795585.1

568 aa

284

568

RNase_T

PF00929 RNase_T 216-362 aa

XP_057795586.1

504 aa

252

504

RNase_T

PF00929 RNase_T 152-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795583.1`	Pfam	`PF00929`	RNase_T	Domain	217	363	3.4e-12	47.9	Exonuclease
`XP_057795585.1`	Pfam	`PF00929`	RNase_T	Domain	216	362	3.4e-12	47.9	Exonuclease
`XP_057795586.1`	Pfam	`PF00929`	RNase_T	Domain	152	298	2.7e-12	48.2	Exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939602.1
GAAATGCTATATATAATGTCCGGCTCCATAAACAATCTCAACGTCGGGTTTGCACCCAATTTAATTTTAAAATAAACTATATATATGCATACAAATTAGGGTTTTTTTTCATAATCACTCAATCATAGTAGCACTTTAAATAAGAATAAATTTAGGGCTTAGCCAAAATTGATCAAACCTCAGAAATTTATTTCTAGTTGTTTCTCTTCATCCGTGACAACATGAATTCCACAGACGAGGAACTCCAGACGCACAATGAG...

XM_057939600.1
ACGTCGGGTTTGCACCCAATTTAATTTTAAAATAAACTATATATATGCATACAAATTAGGGTTTTTTTTCATAATCACTCAATCATAGTAGCACTTTAAATAAGAATAAATTTAGGGCTTAGCCAAAATTGATCAAACCTCAGAAATTTATTTCTAGTTGTTTCTCTTCATCCGTGACAACATGAATTCCACAGACGAGGAACTCCAGACGCACAATGAGGGAAGCACCGAAGACAGCGGCAATGCAAAATCCTTCTTTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131011766
ATGAATTCCACAGACGAGGAACTCCAGACGCACAATGAGGGAAGCACCGAAGACAGCGGCAATGCAAAATCCTTCTTTGATATCTATGGCCCAGAGGCAAGAGCAGACGTCGAATTTAAGCAGACAGAATCCACCTCAACCTTGAATTTCCAGGATGTCCAAGGACTTGCCACCTGGGTGCTTGCTGAGGGCTTCATGCCGTCGTGGGTTTTTATTAAAAACAAGCCCTTAATTCCCAAAGTGGTGATGCTTTATATCCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057795583.1
MNSTDEELQTHNEGSTEDSGNAKSFFDIYGPEARADVEFKQTESTSTLNFQDVQGLATWVLAEGFMPSWVFIKNKPLIPKVVMLYIPGLDAALYLSQSKLLKSFKECCGIPRAVLALSCASDGMQTVDALLTCKIKRKRDEDEQIEKKAARISSQAGNCDSSGDASPIDLKGNLPFPVTYYTLTPRQLEDNGYCHKDPDFLSTLPAPSATLLHGILALDCEMCITRKGFELTRITLVDTTGQVLLDKLVKPANAITDYNT...

XP_057795585.1
MNSTDEELQTHNEGSTEDSGNAKSFFDIYGPEARADVEFKQTESTSTLNFQDVQGLATWVLAEGFMPSWVFIKNKPLIPKVVMLYIPGLDAALYLSQSKLLKSFKECCGIPRAVLALSCASDGMQTVDALLTCKIKRKRDEDEQIEKKAARISSQGNCDSSGDASPIDLKGNLPFPVTYYTLTPRQLEDNGYCHKDPDFLSTLPAPSATLLHGILALDCEMCITRKGFELTRITLVDTTGQVLLDKLVKPANAITDYNTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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