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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002791`

染色体: Chr02 坐标: 47962680-47966929 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002791`
名称	SmilChr02G002791
描述	protein kinase STUNTED
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47962680 - 47966929 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011822`
GeneID	`131011822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011822`
原始查询	`SmilChr02G002791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein kinase STUNTED
产物	protein kinase STUNTED
Arabidopsis	`AT1G77280` (AT1G77280) kinase with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844064] identity=58.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0194900` (OsRLCK315) - identity=47.6; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00582 (Usp); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011822

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057795667.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057795667.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795667.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795667.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795667.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47963169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B69,B9,C28,C78
`Chr2:47963196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C86
`Chr2:47963217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B60,B71,C62,D7
`Chr2:47963995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:47964092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B131,C86
`Chr2:47964446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B74,C43,D9
`Chr2:47964484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:47964737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B91,D2
`Chr2:47964871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B80,C20,C60
`Chr2:47964919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B54,B80,C44
`Chr2:47964928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B54,B80,C44
`Chr2:47964973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B54,B80,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795667.1

753 aa

376

753

Usp

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00582 Usp 13-148 aa PF00069 Pkinase 396-662 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 397-662 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795667.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	13	148	5.1e-07	31.0	Universal stress protein family
`XP_057795667.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	396	662	7.7e-42	144.2	Protein kinase domain
`XP_057795667.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	397	662	4.5e-38	131.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939684.1
AAACAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGCCCATTTGAAGGCCGAAAAGCAAACTAGCAAAGTGTAGGTCATTGTAACTCGTAATAACTTACCCAAGCAGTGCACCAATTCCAATAGTTTACAAACTAATTTCTTTTTGTTAGGAGAGAAGCATATGAGTTCCTGACATCCAACGTCTGCTGAATTCTTGAAAAGCAAACCAAGAAAACTACTCCAGGATTCAGTTACATACAATTAACCACCGCAAGAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011822
ATGGTGGTTGCCGGCGGCGAAGAGAGCTCCGGCGGGCGCACGGTGGTGGTGGGGGTGAAGCTGGACTTGTACAGCAGAGAGCTGCTCACGTGGGCTCTCGTCAAAGTTGCTCAAGCTGGTGATCGCGTCATCGCGCTTCATGTTCTCAAGAACAACGAAATTGTTGATCGCGATGGAAAATCATCCCTTCTCTCCCTGGTTAAAGCTTTTGATTCGATTCTTGAAGTTTACGAAGGATTCTGTAATTTAAAGCAGGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795667.1
MVVAGGEESSGGRTVVVGVKLDLYSRELLTWALVKVAQAGDRVIALHVLKNNEIVDRDGKSSLLSLVKAFDSILEVYEGFCNLKQVDLKLKICRGSSIQKILVREAKSYYASEVIVGTAQTHHTIRSSASVAKYCAKKLSKECSVLAVNNGKIVFHRESSLASRVSVKELEHNRRNGLLTALQRSFSKNIKVLNDGDPIKPMLTWEDGGGCGKSEEKCSICTPDSVTWHKACRGAAEEPAKDEGERDSSMAIVPVEKVEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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