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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002828`

染色体: Chr02 坐标: 48378626-48385626 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002828`
名称	SmilChr02G002828
描述	beta-galactosidase 16-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48378626 - 48385626 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011855`
GeneID	`131011855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011855`
原始查询	`SmilChr02G002828`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-galactosidase 16-like
产物	beta-galactosidase 16-like
Arabidopsis	`AT1G77410` (BGAL16) beta-galactosidase 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844078] identity=63.1; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0428100` (OsBgal6) - identity=58.4; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004565 (beta-galactosidase activity); GO:0005618 (cell wall); GO:0005773 (vacuole); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01301 (Glyco_hydro_35); PF02449 (Glyco_hydro_42); PF17834 (GHD); PF21467 (BetaGal_gal-bd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057795716.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795716.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795716.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795716.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48378759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B78,C33,C36
`Chr2:48378774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B118,B83,D4
`Chr2:48378776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B101,B35,B45,C12
`Chr2:48378842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:48378984`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	165	A10,A11,A13,A14,A15,A2,A21,A22,A23,A3,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B14,B15,B18,B19,B2,B21,B23,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B54,B56,B57,B58,B59,B64,B65,B67,B69,B7,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B82,B83,B85,B86,B89,B91,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C23,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C70,C72,C75,C77,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D11,D3,D4,D5,D9
`Chr2:48378987`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	164	A10,A11,A14,A15,A2,A21,A22,A23,A3,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B14,B15,B18,B19,B2,B21,B23,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B54,B56,B57,B58,B59,B64,B65,B67,B69,B7,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B82,B83,B85,B86,B89,B91,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C23,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C70,C72,C75,C77,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D11,D3,D4,D5,D9
`Chr2:48379018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B100,B35,B45,C12
`Chr2:48379236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,D4
`Chr2:48379267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:48379305`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A10,B115,B119,B59,B62,B85,C11,C24,C31,C33,C46,C52,C69,C80,C83
`Chr2:48379518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:48379529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B27,C25,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795716.1

707 aa

354

707

Glyco_hydro_35

Glyco_hydro_42

GHD

BetaGal_gal-bd

PF01301 Glyco_hydro_35 42-349 aa PF02449 Glyco_hydro_42 65-142 aa PF17834 GHD 372-428 aa PF21467 BetaGal_gal-bd 617-682 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795716.1`	Pfam	`PF01301`	Glyco_hydro_35	Domain	42	349	3e-111	372.8	Glycosyl hydrolases family 35
`XP_057795716.1`	Pfam	`PF02449`	Glyco_hydro_42	Domain	65	142	7.5e-05	23.0	Beta-galactosidase
`XP_057795716.1`	Pfam	`PF17834`	GHD	Domain	372	428	1.9e-24	85.8	Beta-sandwich domain in beta galactosidase
`XP_057795716.1`	Pfam	`PF21467`	BetaGal_gal-bd	Domain	617	682	3.8e-28	98.1	Beta-galactosidase, galactose-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939733.1
TAATTAATGCTAGATTTCCCGCATGCTTCAATTTTGAGTTGATGTGTTTCCGTATGCTATAATTAACCAAGTTAATGGCGCAGTTGATGCATAATCTGCGAGAGAGAGAGATGGTGGGGTGGGTGTTGGTGTTGTGGTTGGGCATGGCGGTGGTAGCTGCCGCCGCACTTGGTGGCCAAGTCAGGTATGATGGAAGGTCGATAATCGTTGATGGCCACCGGAAGCTTATCTTCTCTGGTTCTATTCATTATCCTCGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011855
ATGGCGCAGTTGATGCATAATCTGCGAGAGAGAGAGATGGTGGGGTGGGTGTTGGTGTTGTGGTTGGGCATGGCGGTGGTAGCTGCCGCCGCACTTGGTGGCCAAGTCAGGTATGATGGAAGGTCGATAATCGTTGATGGCCACCGGAAGCTTATCTTCTCTGGTTCTATTCATTATCCTCGAAGCACGCCTCATATGTGGCCATCTTTGATATCAAAAGCCAAACAGGGAGGACTTCATGCCATTGATACCTATGTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795716.1
MAQLMHNLREREMVGWVLVLWLGMAVVAAAALGGQVRYDGRSIIVDGHRKLIFSGSIHYPRSTPHMWPSLISKAKQGGLHAIDTYVFWNLHEPQQGQYYFSGRRDIVRFMKEVHSQGLYVCLRIGPFIEAEWSYGGLPFWLHDVPGIVFRSDNEPFKIHMQNFTTKIVNMMKSEKLFASQGGPIILSQIENEYQNVEKGFGDKGPPYVRWAAEMAVGLKTGVPWVMCKQDDAPDPVINACNGLRCGETFVGPNSPNKPAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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