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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002835`

染色体: Chr02 坐标: 48496202-48499500 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002835`
名称	SmilChr02G002835
描述	aspartic proteinase Asp1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48496202 - 48499500 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011862`
GeneID	`131011862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011862`
原始查询	`SmilChr02G002835`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase Asp1-like
产物	aspartic proteinase Asp1-like
Arabidopsis	`AT1G44130` (AT1G44130) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841016] identity=56.5; qcov=0.858; evalue=3.39e-162; confidence=high
Rice	`Os12g0177500` (OsAsp3) - identity=56; qcov=0.847; evalue=6.71e-159; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057795728.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057795728.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057795728.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795728.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795728.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48496677`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:48496677`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:48496862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B113,B17,B64,D3
`Chr2:48497101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,C39,D4
`Chr2:48497112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr2:48497143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:48497243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B132,B32,C78
`Chr2:48497333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:48497345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:48497513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B78,C74
`Chr2:48497527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B78,C74,D11
`Chr2:48497549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C43,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795728.1

445 aa

222

445

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 57-229 aa PF00026 Asp 57-403 aa PF14541 TAXi_C 269-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795728.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	57	229	1.2e-47	163.1	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057795728.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	57	403	2.1e-22	80.7	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057795728.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	269	402	6e-19	69.1	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939745.1
TAAAATCTCCCCGTCCAGTAAAAAGAGAAGCAAATTTGTCATAAAATCAGGATCATTTTAGTCTAGAAAATGGAATAATGAGTATCGTCCAAACGCGTCATCCGTCTCGCGTACCGCGTGCAAATGGAAATTTCCAAGAACACTCAAAATCCTGATGCAGAAATTCAATATATGAGTTTTGTATGTAGTTATGGAGATGGAGATACTGCATAGCTTGCGCACAGAAACTTCCAACTGATTTCATTTCTTTAAATTATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011862
ATGCATAGAGAGTTGTACCTCAAAGCATTGGTGTTGTTCCTTTTGACATGGATTGCAGCTGCCGCATACCAGCCTCACACAATCAGCAAAAGCATCTTCAAATCTGGCAGAAGCTTTCGCTCCTCCGTGATTTTCCCTGTCTCTGGAAATGTTTATCCAAAAGGGTACTATCATGTAACAATGAATGTGGGCCAGCCTCCCAAACCATACTTTCTTGATATCGATACTGGCAGTGACCTTACATGGCTTCAGTGTGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795728.1
MHRELYLKALVLFLLTWIAAAAYQPHTISKSIFKSGRSFRSSVIFPVSGNVYPKGYYHVTMNVGQPPKPYFLDIDTGSDLTWLQCDAPCTKCTPAPHSLYKPKRNLITCLDPVCVSLNGPGNPKCQSPEEQCDYEVDYADHGSSLGVMVKDSFPLRFTNGTIVAPKLAFGCGYNQEVQDTAHLPYTDGVLGLGIGKSSILAQLRNMGLIRNVIGHCLSRQGGGFLFFGDDFLPDSGIVWTPLLSKSKYYSLGPANLQIGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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