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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002848`

染色体: Chr02 坐标: 48658200-48662685 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002848`
名称	SmilChr02G002848
描述	protein disulfide-isomerase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48658200 - 48662685 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011872`
GeneID	`131011872`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011872`
原始查询	`SmilChr02G002848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein disulfide-isomerase
产物	protein disulfide-isomerase
Arabidopsis	`AT1G21750` (PDIL1-1) PDI-like 1-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838779] identity=63.8; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0199200` (ESP2) - identity=62.7; qcov=0.927; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003756 (protein disulfide isomerase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006457 (protein folding); GO:0034976 (response to endoplasmic reticulum stress)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13098 (Thioredoxin_2); PF13848 (Thioredoxin_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011872

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057795743.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	1.00000	`XP_057795743.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057795743.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795743.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795743.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48658414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:48658415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:48658469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr2:48658560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:48659269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C5
`Chr2:48659378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:48659409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C53
`Chr2:48659737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:48659778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795743.1

494 aa

247

494

Thioredoxin

Thioredoxin_2

Thioredoxin_6

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 31-137 aa PF13098 Thioredoxin_2 42-137 aa PF13848 Thioredoxin_6 167-352 aa PF00085 Thioredoxin 375-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795743.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	31	137	1.1e-57	193.1	Thioredoxin
`XP_057795743.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	42	137	2.6e-15	57.5	Thioredoxin-like domain
`XP_057795743.1`	Pfam	`PF13848`	Thioredoxin_6	Domain	167	352	8.6e-28	98.2	Thioredoxin-like domain
`XP_057795743.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	375	478	1.1e-57	193.1	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939760.1
CGAAAAAGGACACATTTGTAATTTAAGCGATATCCGATGACAGTCACTCTGTAATCTCGTGAACCTTAAGAAGTTAAAACCTTATAAAACCCCAAATCCCAACGCGTGGCTACGGGTACACTACTCCTCACTAGCTAGTAACGGAATTTGAGAGCAAAACACCAGAATTTTCTGCGAGCTGAGATCTACAACAGCCATGTCCAATTTCTGGATGCCATTGTTGCTGATCGCCTTCGCCGTCGCCGGAACCATCTCCACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011872
ATGTCCAATTTCTGGATGCCATTGTTGCTGATCGCCTTCGCCGTCGCCGGAACCATCTCCACTGCCGAGGAATCAGAGTCGAAAGAGTTTGTGGTGACATTAGACCACTCCAATTTCACTGATTTCGTCGCCAAGCACAAGTTCGTCGTCGTCGAGTTCTACGCGCCTTGGTGTGGTCACTGCAAGAAACTTGCTCCAGAGTATGAAAAAGCTGCTTCTGTTCTAAGCACAAGTGATCCTCCGGTTGTCTTAGCAAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795743.1
MSNFWMPLLLIAFAVAGTISTAEESESKEFVVTLDHSNFTDFVAKHKFVVVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAASVLSTSDPPVVLAKVDANEEQNKAISNEFEVRGFPTIKILRYGGSVVQEYKGPRDADGIVTYLKKQSGPASFEIKAPEEASSIIDDNKILVVGVFPEFSGEKFENFTTLAERLRADYEFGHTLVAKVLPRGDSSATGPLVRLFKPFDELFVDFEEFDVDALVKFVEETSTPTVTLFNKDPKNHPFVIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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