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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002892`

染色体: Chr02 坐标: 49211469-49213739 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002892`
名称	SmilChr02G002892
描述	uncharacterized SmilChr02G002892
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49211469 - 49213739 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011919`
GeneID	`131011919`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011919`
原始查询	`SmilChr02G002892`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826373]; symbol=AT4G08230; hit=AT4G08230; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826373]; symbol=AT4G08230; hit=AT4G08230; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G08230` (AT4G08230) glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826373] identity=58.4; qcov=1.11; evalue=3.67e-33; confidence=medium
Rice	`Os03g0263700` - identity=58.9; qcov=1.05; evalue=2.23e-32; confidence=medium
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006816 (calcium ion transport); GO:0032469 (endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF10961 (SelK_SelG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011919

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057795802.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057795802.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057795803.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057795802.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057795803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49213254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C87
`Chr2:49213306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C53
`Chr2:49213390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:49213446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B4,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795802.1

143 aa

143

SelK_SelG

PF10961 SelK_SelG 2-79 aa

XP_057795803.1

102 aa

102

SelK_SelG

PF10961 SelK_SelG 2-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795802.1`	Pfam	`PF10961`	SelK_SelG	Family	2	79	5.8e-22	78.8	Selenoprotein SelK_SelG
`XP_057795803.1`	Pfam	`PF10961`	SelK_SelG	Family	2	79	1.7e-22	80.5	Selenoprotein SelK_SelG

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939820.1
GGCAAACGCTGATTGGGTCTAGCTACTCAACAATCGTTGACTTACGTGTCGAAATAATAAACGGCCTTCTGGCGGTGTTCTCATGATATCGGTCACATCTGATTACTACCCCTTCTATATATCGATTTGTTTCAAGCCTGTGAACAAACCAAGGAAGACTCCGGAGAAGAGTCGTTTGTTCCCACCATGGCATACGTTGAGAGAGGTGTTATCAAAGATAAGAGATCAATATGGCGACTGAAAACAATCACAGACTTCTT...

XM_057939819.1
AACGGCCTTCTGGCGGTGTTCTCATGATATCGGTCACATCTGATTACTACCCCTTCTATATATCGATTTGTTTCAAGCCTGTGAACAAACCAAGGAAGACTCCGGAGAAGAGTCGTTTGTTCCCACCATGGCATACGTTGAGAGAGGTGTTATCAAAGATAAGAGATCAATATGGCGACTGAAAACAATCACAGACTTCTTCTGGGCCATAATCAATTTGATTCGGGCCTTTTTTGCCACGATGTTTTCGATGGAGAAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011919
ATGGCATACGTTGAGAGAGGTGTTATCAAAGATAAGAGATCAATATGGCGACTGAAAACAATCACAGACTTCTTCTGGGCCATAATCAATTTGATTCGGGCCTTTTTTGCCACGATGTTTTCGATGGAGAAGTCTGAAGCCTATCGGAAAGGTTCCGGTGCCAGCAAGAAATGGGATGGTGGTGGTCCAGGAGGTCCAGGAAGTGGCCCATACGGTGGTGGTCCACGTGGGCCACCCCGTGGATTAGATAACGTTAGAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795802.1
MAYVERGVIKDKRSIWRLKTITDFFWAIINLIRAFFATMFSMEKSEAYRKGSGASKKWDGGGPGGPGSGPYGGGPRGPPRGLDNVRGIDHSKFFPHHVLIFPVLFSFTVLFVIDLKYKCCFRCSSCLWLLLWRLRKQLILHKR

XP_057795803.1
MAYVERGVIKDKRSIWRLKTITDFFWAIINLIRAFFATMFSMEKSEAYRKGSGASKKWDGGGPGGPGSGPYGGGPRGPPRGLDNVRGIDHSAAPACGSCCGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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