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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003417`

染色体: Chr02 坐标: 55402797-55406595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003417`
名称	SmilChr02G003417
描述	thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55402797 - 55406595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010397`
GeneID	`131010397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010397`
原始查询	`SmilChr02G003417`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like
产物	thylakoidal processing peptidase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G30440` (TPP) thylakoid processing peptide [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817595] identity=51.9; qcov=0.979; evalue=7.26e-118; confidence=high
Rice	`Os09g0453400` (OsSigP6) - identity=44.3; qcov=1.04; evalue=1.39e-97; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006465 (GO:0006465); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0010027 (thylakoid membrane organization)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10502 (Peptidase_S26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793880.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057793880.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057793880.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057793880.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793880.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55403364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C25
`Chr2:55403673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:55403798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C48
`Chr2:55403865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:55405038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:55405331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B42,B43,B65
`Chr2:55405919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793880.1

386 aa

193

386

Peptidase_S26

PF10502 Peptidase_S26 207-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793880.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	207	364	3.1e-41	141.8	Signal peptidase, peptidase S26

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937897.1
GGCGTAGCACTTGTTCCGATCCCGGCAATATGATTGTATGGAAAATTTCCTGTGTACATGTCAAAGCATTTAAAAGTTGATTTTATTTTTGGGAAGAAAACAATTTTAAATTGATATAACTCGGGGAAATTAAAAAAAGGAGAGAGAGATTTATTACGCCGTCTGGAGTCTTCTCACCTGCGACTGCGATCCCTTTCCTCATAGCGTGGGAACGCGTAGGGTTTTGATTTTCTGTTCTGCGCAAAATTACTCCATTTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010397
ATGGCGATTCGGTTCACCGTCAAGTACTCGGCGTCCGTCGCCTCTAACATGACGGCTTCGTGCGCCGCGTCCGGGAAATTCTTTGGATCCCGGTTCGTCGATGATTGCATACAGAGATCCCGCATCTTTCAGCACCCTCCCTCGCAGAAGCCGGACTCCAATTACGCCGACTTCCGCCGCACTAAATGGAAGAGAAATCCGATCAACCCGACCCCCGCCTTGTGCTCTAAACTGGCCGGAGAGATTCTCGGAGGAAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793880.1
MAIRFTVKYSASVASNMTASCAASGKFFGSRFVDDCIQRSRIFQHPPSQKPDSNYADFRRTKWKRNPINPTPALCSKLAGEILGGNSQSPLVLGLISLLMQSVGTSSSSTVLGISPLKASSAISFFRLSKWLPCNEPSFREVDRETLAGGSSGEAVNAKSVGGLKVLAAAASGDGDRRVGVSPERISGVSNSWYLKLKNLGFTSEDAKATFTALSIRILFKSTLAEPRSIPTTSMYPTLDVGDRILAEKVSYLFKKPEVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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