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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003446`

染色体: Chr02 坐标: 55717544-55720811 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003446`
名称	SmilChr02G003446
描述	octanoyltransferase LIP2p2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55717544 - 55720811 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010421`
GeneID	`131010421`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010421`
原始查询	`SmilChr02G003446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	octanoyltransferase LIP2p2, chloroplastic-like
产物	octanoyltransferase LIP2p2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G47578` (AT1G47578) Biotin/lipoate A/B protein ligase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723096] identity=64.9; qcov=0.84; evalue=1.36e-120; confidence=high
Rice	`Os12g0596000` (OsALDH12B1) - identity=65.5; qcov=0.806; evalue=3.36e-113; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009249 (protein lipoylation); GO:0033819 (lipoyl(octanoyl) transferase activity)
KEGG	smil00785 (Lipoic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF21948 (LplA-B_cat)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010421

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793918.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057793918.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793918.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793918.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55718253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C47,C48
`Chr2:55719037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C47,C48,D10
`Chr2:55720321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C70,C79
`Chr2:55720450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B120,B77,D7
`Chr2:55720543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:55720555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B17
`Chr2:55720560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C18
`Chr2:55720613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	B125,B129,B16,B18,B32,B45,B6,B64,B69,B91,C26,C27,C39,C49,C50,C63,C65,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793918.1

288 aa

144

288

LplA-B_cat

PF21948 LplA-B_cat 54-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793918.1`	Pfam	`PF21948`	LplA-B_cat	Domain	54	234	1.1e-40	140.4	Lipoyl protein ligase A/B catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937935.1
ACAATTATATAGTTTGGCCCCGATATGAGTGCTGTGACAATGTTTAGTTGCTGAAGTTGAAGAACAAGTCCATACCATAAAAATGGAGATTTGATGCTTCCAACAAACTTGGACGCCACCCGCACCAGCTACATCAGATCTTCCGCTAGCAGCCGCCGCTCAACTGAGGGTCACTGTATACTACTCCACTACTGTGCTCTTCTGGTTTTGCTTTGGTTGCTCCGCTGCTACAAACTAACACTCAGTTTGAAGCTTTTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010421
ATGAATTTATTGTGCAATCCAACTCTAACCTATGTGCCGACGCCATTGATTCAAAACCCCTCTAAAAGAACCAGCAAAATCCATTCTTGTCAACTTATTTCAACGACCCACAAAACCAGAAGAAGATGTGATTTGTATGACTTGCACAAGGAGGTGGTGCCATATGCAGAGGCGTGGTCGTGGCAGAAGGCCATTGTGACGGAGAGAAGAGCACTGAGTGACAGAAATGAAGATTTTTCGGACAGTTTGATTATCTTACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793918.1
MNLLCNPTLTYVPTPLIQNPSKRTSKIHSCQLISTTHKTRRRCDLYDLHKEVVPYAEAWSWQKAIVTERRALSDRNEDFSDSLIILQHHPVYTMGTGSCDNYLNFDVSNAPFDLYRTERGGEVTYHGPGQLVMYPIINLRYYKMDLHWYLRSLEEVVIRAISSTFSIEASRVEGLTGVWVGDAKLAAIGIKVSKWIAYHGLALNVTTDLTPFDQIVPCGIRDRQVGSIKGLLNDNRHRVEDYDLNDDQDLMHTACKSLVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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