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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003833`

染色体: Chr02 坐标: 59974151-59975828 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003833`
名称	SmilChr02G003833
描述	transcription factor MYB73-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59974151 - 59975828 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010777`
GeneID	`131010777`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010777`
原始查询	`SmilChr02G003833`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB73-like
产物	transcription factor MYB73-like
Arabidopsis	`AT4G37260` (MYB73) myb domain protein 73 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829880] identity=46.9; qcov=1.08; evalue=1.26e-95; confidence=high
Rice	`Os09g0106700` (R2R3-MYB) - identity=67; qcov=0.593; evalue=6.46e-71; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010777

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794421.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794421.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794421.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794421.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794421.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59974605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D8
`Chr2:59974605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:59974705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B60,B79,C27
`Chr2:59974765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr2:59975194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:59975225`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr2:59975225`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr2:59975359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,C37,C75,D1
`Chr2:59975443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794421.1

317 aa

158

317

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 11-57 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 14-72 aa PF00249 Myb_DNA-binding 65-107 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 66-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794421.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	11	57	6.7e-40	135.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057794421.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	14	72	3.7e-29	101.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057794421.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	65	107	6.7e-40	135.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057794421.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	66	112	3.7e-29	101.4	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938438.1
ATACCCGGAATTTATGTAAATCTGATTTCCATAGGTGTCCCGCTTAATCCCCCGCTAATCGACGCGTGTCCCGTGCCAGCTATACACTAGTAACTGCCCTTTCAGCCGGTCACCGCCACCGGCTCAGCCGGTAATCCCTATCCTCTTTGGCCTCCCTCGTATATATATACCCCTCTCCTCCGCCTCCTCTTTCCTCTCATCGCTAAGGCGAGGCTCCGCCTCTCCAACTATTTAACCTACACATACAAAATCCTGCATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010777
ATGGCGGCGAGAAGCGAAGCGGATCGGATAAAGGGCCCGTGGAGCCCGGAGGAGGACGAGCTGCTTCAGAAGCTTGTGGAGAAGCACGGCCCGAGGAACTGGTCGTTGATCAGCAAATCGATCCCAGGGCGGTCGGGGAAATCGTGCCGGCTGCGGTGGTGCAACCAGCTCTCGCCGCAGGTGGAGCACCGGGCCTTCACGCCGGAGGAGGACGAGACGATCATCCGCGCCCACGCGCGGTTCGGCAACAAGTGGGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794421.1
MAARSEADRIKGPWSPEEDELLQKLVEKHGPRNWSLISKSIPGRSGKSCRLRWCNQLSPQVEHRAFTPEEDETIIRAHARFGNKWATIARLLSGRTDNAIKNHWNSTLKRKCVSMSEEFNDFDPEARQPLKRSASVGPGTNISASGFYFNPGSPDGSDMSDSSHSGHLVYRPIARTGGISPPDPLPDPVTSLSLSLPGFDPSPSPSADVSARSVLELDPQIVVDPPVLPQHSIQMLASHPPPPPPPPAAPAAVQTHQFAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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