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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004036`

染色体: Chr02 坐标: 62659123-62662197 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004036`
名称	SmilChr02G004036
描述	tryptophan aminotransferase-related protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62659123 - 62662197 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010969`
GeneID	`131010969`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010969`
原始查询	`SmilChr02G004036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tryptophan aminotransferase-related protein 4-like
产物	tryptophan aminotransferase-related protein 4-like
Arabidopsis	`AT1G34060` (AT1G34060) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840303] identity=49.6; qcov=0.996; evalue=1.57e-165; confidence=high
Rice	`Os01g0717700` - identity=48.2; qcov=1.02; evalue=7.68e-157; confidence=high
GO	GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0016846 (carbon-sulfur lyase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2); PF04863 (EGF_alliinase); PF04864 (Alliinase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010969

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057794670.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057794670.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057794670.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794670.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794670.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62660323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B68
`Chr2:62660448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:62660482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:62660505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B127,B83,B98
`Chr2:62660532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B104,B35,C36
`Chr2:62660728`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A1,A13,B117,C27,C3,C53
`Chr2:62660846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:62661515`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr2:62661515`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B69
`Chr2:62661684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,D7
`Chr2:62661936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B82,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794670.1

456 aa

228

456

EGF_alliinase

Alliinase_C

Aminotran_1_2

PF04863 EGF_alliinase 40-95 aa PF04864 Alliinase_C 97-447 aa PF00155 Aminotran_1_2 139-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794670.1`	Pfam	`PF04863`	EGF_alliinase	Domain	40	95	8e-25	87.7	Alliinase EGF-like domain
`XP_057794670.1`	Pfam	`PF04864`	Alliinase_C	Domain	97	447	1.9e-142	475.2	Allinase
`XP_057794670.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	139	431	7.1e-06	26.2	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938687.1
ACATAAATAAATATATAAAATACATCATCAAAACCCTATAAAATATGGTCATATACTAAATTTCAACATCAACATACATCTTTTTTTTATGTTCCTATAAGTGGATCCATTTATGAACGTTAAATATATAAGTGGGGCTAGAAATTGTGTAGTCCAGCAGGTTCCCTTTCAGCAGAAATGAACACAAATTAATATATATAGAGTGGGAGAAAAGAATTCAAGAAGAAAAAGGAAATAAATTGAGGTGGATGCCATGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010969
ATGGGAAGCAGTTATTGTTGGTTAAGTTTGTTGTTGCTGAGTTCTGCAATTCTTAATATTTATTTTGTGAGTAATTCATATATTGAGGGGAAGGGGAAGGTGAAGGTGAAGGTTGGTTGGAGTGAAGAAGCTGCAGCAAAAGCAGAAGAAGTTGCATCAATTAATTGTTCAAATCATGGAAGAGCTTATTTGGATGGAGTGATTAGTGAAGAAGATGGGAAGCCTGTTTGTGAGTGCAACACTTGCTATGGAGGCTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794670.1
MGSSYCWLSLLLLSSAILNIYFVSNSYIEGKGKVKVKVGWSEEAAAKAEEVASINCSNHGRAYLDGVISEEDGKPVCECNTCYGGSDCSLLSPNCAANADSGDPLFLEPFWMQHAASSGVVVAGWHRMSYVFPDSTYISQQLETHIRLIHRLTRNALTHGKRIIFGGGSTQLLNAALYALSANLSSPASVVAAVPFYPLYKQQADFFQNNNYKFQGDAWLMRNSNSNVIEFVTSPNNPDGNLREPVCKGPSARPIYDHAY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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