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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004093`

染色体: Chr02 坐标: 63216526-63219866 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004093`
名称	SmilChr02G004093
描述	3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63216526 - 63219866 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011022`
GeneID	`131011022`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011022`
原始查询	`SmilChr02G004093`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase 1-like
产物	3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase 1-like
Arabidopsis	`AT1G76490` (HMG1) hydroxy methylglutaryl CoA reductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843982] identity=73.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0492700` (HMGR) - identity=70.8; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004420 (hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH) activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005778 (peroxisomal membrane); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0008299 (isoprenoid biosynthetic process); GO:0015936 (coenzyme A metabolic process); GO:0016126 (sterol biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00368 (HMG-CoA_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011022

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057794739.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057794739.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794739.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794739.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63216868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:63216872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:63216976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B90,C84
`Chr2:63217247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B80,B84,C24
`Chr2:63217451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B125,B17,B90,B92
`Chr2:63217509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:63218082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B20,B34,C16
`Chr2:63218874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B32,B69,C83
`Chr2:63218953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:63219090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:63219211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:63219409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B20,B34,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794739.1

565 aa

282

565

HMG-CoA_red

PF00368 HMG-CoA_red 179-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794739.1`	Pfam	`PF00368`	HMG-CoA_red	Family	179	555	4.5e-145	484.0	Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938756.1
AGTAGAGCGCAAGAAGAGGAGAAGCAAGGAAACAAACAAAAAGGGGATGCCAGCGCATAATTTGAATATTTGAGGCTCTCCACTATAAAGAAACCAACTCCCGACACCATCGCTGCTCCGCCCCTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTTCACTCCTCTCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCCTGGTTATGGATATCCGCCGGAGGCCAGCCCGACCTCCTCCTCCGCCCTCCGCCTCCACCTCCACATCCTCCGCAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011022
ATGGATATCCGCCGGAGGCCAGCCCGACCTCCTCCTCCGCCCTCCGCCTCCACCTCCACATCCTCCGCAGTGGATCACCAACCCTCCTCCCCTAAAGCCTCTGATGCGCTCCCGCTCCCGCTCTACCTCACCAACGGCATTTTCTTCACGCTCTTCTTCTCCGTCGCCTACTTCCTCCTTCACCGCTGGCGCGATAAGATCCGCAATTCGACGCCGCTCCACATCCTCACGCTCTCCGAGCTCGCCGGAATTCTCTGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794739.1
MDIRRRPARPPPPPSASTSTSSAVDHQPSSPKASDALPLPLYLTNGIFFTLFFSVAYFLLHRWRDKIRNSTPLHILTLSELAGILCLIASFIYLLGFFGIDFVQSFISKPESDEDHQRFILHEDRKIHCGLPPPAPVVAKAKAAVELPQDDEEVVDRVVSGEIPSYSLESRLGDCLRAAKIRREAVQRLTGRGVDGLPLEGFDYDSILGQCCEMPVGYVQIPVGIAGPLLLNGCEYSVPMATTEGCLVASTNRGCKAIYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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