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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004125`

染色体: Chr02 坐标: 63509295-63515113 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004125`
名称	SmilChr02G004125
描述	uncharacterized SmilChr02G004125
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63509295 - 63515113 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011052`
GeneID	`131011052`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011052`
原始查询	`SmilChr02G004125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Serine/Threonine-kinase, putative (Protein of unknown function, DUF547) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838700]; symbol=AT1G21060; hit=AT1G21060; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Serine/Threonine-kinase, putative (Protein of unknown function, DUF547) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838700]; symbol=AT1G21060; hit=AT1G21060; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G21060` (AT1G21060) Serine/Threonine-kinase, putative (Protein of unknown function, DUF547) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838700] identity=47; qcov=0.881; evalue=1.36e-119; confidence=high
Rice	`Os08g0515700` (P0686C03.125) - identity=42.2; qcov=0.887; evalue=3.07e-101; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04784 (DUF547); PF14389 (Lzipper-MIP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011052

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057794782.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794782.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057794782.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794782.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794782.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63511345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C48
`Chr2:63511453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr2:63511469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:63511510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C36
`Chr2:63511737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C47
`Chr2:63511766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:63512927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C83
`Chr2:63512975`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:63512975`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:63512976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B93,C2
`Chr2:63513018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:63513035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794782.1

529 aa

264

529

Lzipper-MIP1

DUF547

PF14389 Lzipper-MIP1 76-112 aa PF04784 DUF547 321-452 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794782.1`	Pfam	`PF14389`	Lzipper-MIP1	Family	76	112	3.1e-08	34.6	Leucine-zipper of ternary complex factor MIP1
`XP_057794782.1`	Pfam	`PF04784`	DUF547	Family	321	452	5e-37	127.4	Protein of unknown function, DUF547

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938799.1
GTCTGGTAATAATAATCACAATTCACAACTAATTGATGATCCGCCTCCCCCACCTTGTCTCCCCCTCTACCATTAATTATTACTATTACTGCGCGCTTCTCTCTCCCCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTTAATGTTTCTATAGTTGTTTCCTTCCCTTCAATGGCTTTCAGCTCTACGACTAAAGATCCCACTTTCATGTTTGACCCTTTTTTGTTTATATGATTACTCATTTGTTTATTCTTACTGAATCTGTGATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011052
ATGCCGCCGGCGGACTTTCCCTCTCCTCCTACTTCTCTCTCCTCCAGTTTGCAGAGTGAGGATCATATACTCAATATGTCGCCAAGACCACCCTCTCACCGTCTCAATTCTGTTGCACATTTGGGGAAAACATCTCTTCACAAGACATCTAATACTAACACTAACAGTGGTGGCTCAGCCTCAGACACCACAAGCTTGATTGCTTCTCCTCATTCCGATTGCAACACAACATCTAAGCCTTCTGCCGAACTGGTGAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794782.1
MPPADFPSPPTSLSSSLQSEDHILNMSPRPPSHRLNSVAHLGKTSLHKTSNTNTNSGGSASDTTSLIASPHSDCNTTSKPSAELVKEIATLEVEILHLERHLLSLYRTAFQQHLPRITEDHVEKMNETPRGGDQLNQPSQKIKPEMSKDHQCENSPTSSLAGPRDLVQVAFQKSSSGREKQRAYSRHRSLADHLGNSRIDDALTCPARLSEDIIRCISSIYCKLANPMATEKGCSVSSTSSFCSSTTFSPRNLSGSWSPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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