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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004311`

染色体: Chr02 坐标: 65468212-65469621 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004311`
名称	SmilChr02G004311
描述	peroxidase 7
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65468212 - 65469621 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013053`
GeneID	`131013053`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013053`
原始查询	`SmilChr02G004311`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 7
产物	peroxidase 7
Arabidopsis	`AT1G30870` (AT1G30870) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839971] identity=55; qcov=0.941; evalue=1.37e-116; confidence=high
Rice	`Os07g0499500` (prx102) - identity=53; qcov=0.928; evalue=3.3e-101; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013053

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057797038.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797038.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797038.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797038.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65468411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:65468507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B69
`Chr2:65468836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B103,B20,B54,C44
`Chr2:65468856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:65468900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:65468946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B114,B2,C54
`Chr2:65469032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:65469223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:65469331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:65469363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B114,B2,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797038.1

321 aa

160

321

peroxidase

PF00141 peroxidase 48-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797038.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	48	282	2.2e-79	267.3	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941055.1
CAAAAAGAATGTAGCAAGGTTCACGTCACCTACTCAATATTATTGGTTTTGTGCGCTCACGTTCATATACTCTTTCGCCACCACATGGATCTATATATATTAGCAACACTAAAATCCAACTCAAAATATTAAAATCTTGTGTAAGATCGTATCCCATAAGAACAAACAAAAAAGAAGAGAAAATTAATGGAGTCCATCAGCAGAAGCTGCTGCTACGCATTGCTGCTGGTGGTGGCGGTAGTTGCAGTTGAGGGCAGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013053
ATGGAGTCCATCAGCAGAAGCTGCTGCTACGCATTGCTGCTGGTGGTGGCGGTAGTTGCAGTTGAGGGCAGCGGCTACGAGTACGACGAGGATCTAAGTTTGTCGTACTACCGTGAGAGCTGCCCTCAGCTGGAACAGATCGTCCACAAAAAACTCAAACTCTGGCTCAAAAACGACTCCACTCTCGCCCCTGCTCTCATCAACCTCCACTACCGTGACTGCGCCGTTAGAGGATGCGATGCTTCGATTCTCCTAGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797038.1
MESISRSCCYALLLVVAVVAVEGSGYEYDEDLSLSYYRESCPQLEQIVHKKLKLWLKNDSTLAPALINLHYRDCAVRGCDASILLEHEGSERTAKASMSLRGFQVIDDIKSEVEKKCPKTVSCADILASAARDATGAVGGPFWSVPYGRKDGRVSLAEEAESLPKGRERITELVELFQSKGLNVLDLVVLSGAHSIGRSGCAAVQHRLFNYKADPSIDPRYLNFLRRKCRWASESVELDAVTPKKLDVQYYKNLEKKMGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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