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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004352`

染色体: Chr02 坐标: 65776748-65782065 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004352`
名称	SmilChr02G004352
描述	oligouridylate-binding protein 1B
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65776748 - 65782065 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013100`
GeneID	`131013100`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013100`
原始查询	`SmilChr02G004352`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oligouridylate-binding protein 1B
产物	oligouridylate-binding protein 1B
Arabidopsis	`AT1G17370` (UBP1B) oligouridylate binding protein 1B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838309] identity=81.5; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0615400` (P0616D06.127-1) - identity=71.7; qcov=0.919; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013100

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797093.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057797093.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057797093.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797093.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057797093.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65777238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:65777289`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B93,C2
`Chr2:65777289`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:65778932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:65781749`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	101	A10,A11,A15,A19,A22,A23,A4,A8,B100,B102,B103,B104,B105,B107,B109,B11,B110,B112,B114,B119,B121,B123,B125,B127,B128,B129,B131,B136,B139,B14,B15,B18,B21,B25,B26,B3,B37,B47,B49,B50,B52,B53,B54,B61,B63,B69,B7,B70,B72,B73,B74,B76,B81,B83,B85,B87,B88,B90,B92,B93,B94,B97,C1,C11,C15,C16,C17,C21,C24,C27,C28,C3,C31,C33,C34,C4,C41,C43,C5,C52,C56,C62,C63,C65,C69,C71,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C87,C9,D10,D3,D4,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797093.1

422 aa

211

422

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-122 aa PF00076 RRM_1 141-211 aa PF00076 RRM_1 262-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797093.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	122	2.8e-47	159.2	RNA recognition motif
`XP_057797093.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	141	211	2.8e-47	159.2	RNA recognition motif
`XP_057797093.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	262	326	2.8e-47	159.2	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941110.1
ATTTGGGCCTTTTTATCGGCAAAAATGGACTTATCGAAAGAAAACCCATTTCATTCATCACTATTTAGCACCGCGTGAAGTGGGGCCCAGTCGAAAAACTTGAGGTATAAATTTGCTGAGAAGCAAATAATTTCCCCTCTTTCAGCGAAAGCATTTTCTTTTTGTCTTTTTTTCTTTCTTTTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTCTTCATTTCCCCCCTTTTCCTCTTTTCCCTCGCTTGACGAGCCCTAAACCGAGAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013100
ATGCAGAATCAGAGATTGAAGCAGCAACAGCATCAGGCGTTGATGCAGCAAGCGCTTCTTCAGCAGCAGTCCCTCTACCATCCAGGCCTCTTAGCTGCTCCGCAGATTGAACCAATTCCTAGTGGAAATCTGCCTCCTGGGTTTGACCCAAGCACATGCCGCAGTGTGTATGTCGGGAACATTCACACGCAGGTGACAGAACCACTTCTTCAAGAAGTTTTTGCAAGTACTGGTCCAGTTGAGAGCTGCAAGCTTGTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797093.1
MQNQRLKQQQHQALMQQALLQQQSLYHPGLLAAPQIEPIPSGNLPPGFDPSTCRSVYVGNIHTQVTEPLLQEVFASTGPVESCKLVRKEKSSYGFIHYFDRRCASLAILTLNGRHLFGQPIKVNWAYASGQREDTSSHYNIFVGDLSPEVTDAMLYACFSVYSSCSDARVMWDQKTGRSRGFGFVSFRNQQEAQSAINDLTGKWLGSRQIRCNWATKGAGTTDEKQNSDAKSVVELTNGSSEEVKEAASTDAPENNPQYT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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