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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004354`

染色体: Chr02 坐标: 65821840-65824485 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004354`
名称	SmilChr02G004354
描述	protein TIFY 10a-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65821840 - 65824485 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013102`
GeneID	`131013102`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013102`
原始查询	`SmilChr02G004354`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmJAZ2` CORE-060; 2015	`KC864779`	`LOC131013102` `SmilChr02G004354` GeneID 131013102	nucleotide CDS and protein BLAST against active nuclear reference, 2026-09-27; identity 99.857%; coverage 97.08%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIFY 10a-like
产物	protein TIFY 10a-like
Arabidopsis	`AT1G72450` (JAZ6) jasmonate-zim-domain protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843577] identity=32; qcov=0.996; evalue=6.28e-25; confidence=low
Rice	`Os03g0402800` (OsJAZ5) - identity=34; qcov=0.901; evalue=1.39e-24; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009611 (response to wounding); GO:0031347 (regulation of defense response); GO:2000022 (regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06200 (tify); PF09425 (Jas_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013102

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797096.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797096.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797096.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797096.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797096.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65822299`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C47
`Chr2:65822299`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C47
`Chr2:65822300`	`T`	`TC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	C47
`Chr2:65822300`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C47
`Chr2:65822315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:65822362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,C37,C7,D6
`Chr2:65822525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B11,C13,C37
`Chr2:65822544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:65822566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:65822641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:65822680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A20,B120,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797096.1

240 aa

120

240

tify

Jas_motif

PF06200 tify 86-117 aa PF09425 Jas_motif 212-230 aa

XP_057797097.1

232 aa

116

232

tify

Jas_motif

PF06200 tify 86-117 aa PF09425 Jas_motif 187-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797096.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	86	117	5.3e-12	45.6	tify domain
`XP_057797096.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	212	230	3.3e-10	40.3	Jas motif
`XP_057797097.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	86	117	5.1e-12	45.6	tify domain
`XP_057797097.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	187	211	3.2e-12	46.7	Jas motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941114.1
ATGGCGACAGCTCATTGTGGAAATCAACAGCCCTCTTCAATAAATAAATCTTCTTTCTCCCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACACTTCTTTATCGAGTAGAATATAAATATTGAAACTCGTTTTCCATCAAATCTTTTTTTATTTGGCGTAGACCCCACATATTCTTCCCTTGAATTTATGCGCAGATTTGGTGAGTCTGTGCAAATGGGTAGATTAACTGCACGATACTAGACTAGTGGAGAAGATATGTCCTCTCTTTC...

XM_057941113.1
AGACCCCACATATTCTTCCCTTGAATTTATGCGCAGATTTGGTGAGTCTGTGCAAATGGGTAGATTAACTGCACGATACTAGACTAGTGGAGAAGATATGTCCTCTCTTTCTATCTCTCTCTTACTTTAGATTTCCTTGGCAATTTTCACGTGCTTATTATTGTAGTCATTAAAAAAAAACAGTCTTTTATGGACAATAAACATTTGATAAGCTTTGATCAATTGTTCACCTCTCCTAACCCTTTTCTTTCATTTCTGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013102
ATGTCTAGTTCAAGAATGGTTTTTGATGGCAGGAGGCAGCCTGGGAGATCAAATTTTGTGCAGACATGTAATCTCTTAAGTCGTTATATTAAGGAAAAAGGGAGTCTCAGAGATTTGAATATCGAAATTGGTGGAAAAGCAGAGAGCCTTGAACACATAGTGAAGCCTGTATTAACTCAATCTTCAATTAAACAACAGCCATTCGTGGCTCCGAAATCGTCCGTTGATGCGCCTACGAGCTGCAAAGAGGATCCAGCAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797096.1
MSSSRMVFDGRRQPGRSNFVQTCNLLSRYIKEKGSLRDLNIEIGGKAESLEHIVKPVLTQSSIKQQPFVAPKSSVDAPTSCKEDPAKPSQLTIFYSGRVLVFDDYPSNKVEELVAFAKKESSCSILSSNMDAAGGPISSSRDGLPPRPHQAGTGSHKAAAISSNASKEKKSSTTTTTTTDANGSGKLNLLEFFFFFFYEIVDGCFWCVVDLPIARRSSLHRFLEKRKDRYVCILSFFYYY

XP_057797097.1
MSSSRMVFDGRRQPGRSNFVQTCNLLSRYIKEKGSLRDLNIEIGGKAESLEHIVKPVLTQSSIKQQPFVAPKSSVDAPTSCKEDPAKPSQLTIFYSGRVLVFDDYPSNKVEELVAFAKKESSCSILSSNMDAAGGPISSSRDGLPPRPHQAGTGSHKAAAISSNASKEKKSSTTTTTTTDANGSDLPIARRSSLHRFLEKRKDRSVVRGPYHQVQEHPGSSSKGDEQLELKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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