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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004361`

染色体: Chr02 坐标: 65886815-65891848 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004361`
名称	SmilChr02G004361
描述	uncharacterized SmilChr02G004361
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65886815 - 65891848 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013107`
GeneID	`131013107`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013107`
原始查询	`SmilChr02G004361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0780700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0780700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G14075` (AT3G14075) Mono-/di-acylglycerol lipase, N-terminal;Lipase, class 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820623] identity=65.4; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0780700` - identity=60.5; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016042 (lipid catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3); PF03893 (Lipase3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013107

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057797105.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057797105.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057797105.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797105.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797105.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65888328`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C4
`Chr2:65888328`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C4
`Chr2:65888330`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C4
`Chr2:65888330`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C4
`Chr2:65889120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:65889208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B114,C54
`Chr2:65891024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:65891304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,C2,C32,C68
`Chr2:65891334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:65891460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:65891535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B94,C74
`Chr2:65891583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797105.1

664 aa

332

664

Lipase3_N

Lipase_3

PF03893 Lipase3_N 56-136 aa PF01764 Lipase_3 192-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797105.1`	Pfam	`PF03893`	Lipase3_N	Domain	56	136	6.2e-17	62.1	Lipase 3 N-terminal region
`XP_057797105.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	192	329	7.1e-27	94.7	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941122.1
TAATTCTGTAATAGTTTCTATTTGCGTGGAAGCAGGAAACTTCAAATACTAAGCTAACCGCAAAAGAAAAAAAAATCGAAATTCCAATTTTGCGTTCAATTGAAGAAAAACTCAAAGCTCAAATCTTCCAAATCCAAAATTTTCCCCAAATTAGCCAAGACGCAAGGAATTTTCATTTCATATCCTTAATTTTCGTGTTGACTGCACCCCAAATTTGTATTCTATTATTTTTCCTTTTTACTTAATTCTCGCATTTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013107
ATGGACTCGAGAATCATGGCAACCGCCACAATGGCCACAGCAGCTGGTGCTGCTGCACTTTTGTATTATACATTAAATAAGAAACTACAGTCAAGTCCAACAACTGGTGATGATGATGACGAAAATGGAGCCGAGATACAAGTTCATGCTCCGCTAGGGATTGAAAGAGTTTCTCATAGACTTATACAAGCTCCTGCAACATGGCTAGAAACAATTTCAACTCTGTCAGAGACCCTTAGATTCACTTATTCAGAAACTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797105.1
MDSRIMATATMATAAGAAALLYYTLNKKLQSSPTTGDDDDENGAEIQVHAPLGIERVSHRLIQAPATWLETISTLSETLRFTYSETLGKWPIGDLAFGISFLLKGRYGNLQVGREFGGSDSIRLKGPEIAADLRYLLNLLTLCWHFSKKPFPKFLEETGYSQEDVILQEPKAGILKPAFTVLIDHKSKTVLLLIRGTHSIKDTLTAVTGAVVPFHHSVVCEGGVSNLVLGYAHGGMVAAARWIAKLSTPCLLTSLNKRPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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