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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004410`

染色体: Chr02 坐标: 66420343-66428750 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004410`
名称	SmilChr02G004410
描述	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66420343 - 66428750 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013159`
GeneID	`131013159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013159`
原始查询	`SmilChr02G004410`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3
产物	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3
Arabidopsis	`AT1G72960` (AT1G72960) Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843627] identity=74.7; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0575000` (RHD3) - identity=73.8; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016320 (endoplasmic reticulum membrane fusion)
KEGG	-
Pfam	PF05879 (RHD3_GTPase); PF20428 (Sey1_3HB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057797183.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057797183.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057797183.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057797183.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797183.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66420792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:66420839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:66420859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:66420887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:66420909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:66421491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B34,B47,C31,C7
`Chr2:66421645`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr2:66421645`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr2:66422485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:66422746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:66422763`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B19
`Chr2:66422763`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797183.1

815 aa

408

815

RHD3_GTPase

Sey1_3HB

PF05879 RHD3_GTPase 46-281 aa PF20428 Sey1_3HB 323-758 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797183.1`	Pfam	`PF05879`	RHD3_GTPase	Domain	46	281	3.3e-118	394.2	Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3) GTPase domain
`XP_057797183.1`	Pfam	`PF20428`	Sey1_3HB	Domain	323	758	5.7e-145	484.1	Sey1 three-helix bundle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941200.1
AAAAAATATACATATAAAAGTACGCGCAAACACATATACAATCACACAGTATTTGTATTGATAAACCCCCATTTGAGATCATCTACTGAAATTCCAACTTCTCCTTCTCTCCTCAATTTCCCCGATCTCGCCGTCTCCGGCAACCTACCACCGTTGATCGGAGTCTGCTCATTACTCGCCGATATGGATAAAAGAGACCATTGTTGCTCAACTCACCTCATAGAAGGGGATGGTACTTTCAATGTCACCGGAGTTGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013159
ATGGATAAAAGAGACCATTGTTGCTCAACTCACCTCATAGAAGGGGATGGTACTTTCAATGTCACCGGAGTTGACAATTTTGTGAAGGAAGTTAAACTTGCTGAATGTGGGCTGTCTTATGCTGTTGTAGCCATCATGGGCCCTCAGAGCAGTGGGAAGAGTACATTGTTGAATCACCTGTTTGGTACGAATTTCAGAGAAATGGATGCTTTAAGGGGGAGGTCACAAACCACAAAAGGAATATGGATGGCACACTGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797183.1
MDKRDHCCSTHLIEGDGTFNVTGVDNFVKEVKLAECGLSYAVVAIMGPQSSGKSTLLNHLFGTNFREMDALRGRSQTTKGIWMAHCVGIEPCTLVMDLEGSDGRERGEDDTAFEKQSALFALAVSDIVLINMWCHDIGREQAANKPLLKTVFQVMMRLFSPRRTTLMFVIRDKTRTPLENLEPILREDIQKIWDSVPKPEAHKETPLSEFFNVEVVALSSYEEKEEQFKEQVASLRQRFFHSIAPGGLAGDRRGVVPASG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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