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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004518`

染色体: Chr02 坐标: 67701657-67703416 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004518`
名称	SmilChr02G004518
描述	40S ribosomal protein S12-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67701657 - 67703416 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008509`
GeneID	`131008509`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008509`
原始查询	`SmilChr02G004518`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S12-like
产物	40S ribosomal protein S12-like
Arabidopsis	`AT2G32060` (AT2G32060) Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817766] identity=69; qcov=0.792; evalue=1.43e-37; confidence=medium
Rice	`Os07g0150200` - identity=75.2; qcov=0.991; evalue=8.49e-49; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01248 (Ribosomal_L7Ae)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008509

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791362.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791362.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057791364.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791364.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791362.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67702580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:67702851`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C74,C86
`Chr2:67702851`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C74,C86
`Chr2:67702853`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C74,C86
`Chr2:67702853`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C74,C86
`Chr2:67703020`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	174	A1,A10,A13,A14,A16,A18,A2,A23,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B128,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B47,B48,B5,B50,B53,B54,B57,B58,B59,B62,B66,B68,B69,B70,B71,B73,B75,B78,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B95,B97,B98,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C22,C24,C25,C26,C27,C3,C30,C34,C35,C38,C4,C40,C44,C46,C47,C49,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C69,C7,C72,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr2:67703086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791362.1

129 aa

129

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 29-112 aa

XP_057791363.1

129 aa

129

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 29-112 aa

XP_057791364.1

106 aa

106

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 29-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791362.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	29	112	1.8e-23	82.8	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family
`XP_057791363.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	29	112	1.8e-23	82.8	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family
`XP_057791364.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	29	101	5.2e-22	78.1	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096308.1
GCATCTAAGGATCCTGCCATGGAGGCCCAATCATATTGGGCTGAACTAAAATTGGTTCAAGTCCAAACGATAGAAGCTAGGGTTTTGGGGTTTTCTTCTTTTTATCCTCTCTCTATAAATTGCGACCAAGATCGTTTCAGCAGCCCTCACTCACGTTTGCTGCTCAACGCTTGATTCCGCAGTTCATATAATTAGAGACCGCCTTTAGCCCGAAGCCAAAATGTCTGGAGAAGAGCCTGTTGTTGTGGAGACACCAGTGC...

XR_009096310.1
TCGTTTTTTGTACGATTATCTTATTCGTTTTTGTTTTGTTTATTAACGTTGTTGCTTTTATTTTCATTTTTCTGGTAACTTTTTGAAGTTGATTAAAATTCAGTCTACAAAAGATGATGGTCTGAGATTAAGATAATTGTTCATATAATTAGAGACCGCCTTTAGCCCGAAGCCAAAATGTCTGGAGAAGAGCCTGTTGTTGTGGAGACACCAGTGCCGGTGGCTGCTCCCACCCTTGGTGAGCCTATGGATATCATGAC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131008509
ATGTCTGGAGAAGAGCCTGTTGTTGTGGAGACACCAGTGCCGGTGGCTGCTCCCACCCTTGGTGAGCCTATGGATATCATGACGGCTCTGCAGCTTGTGCTCAAGAAGTCATTGGCACACGGAGGTCTTGTTCGAGGCCTTCATGAGGGTGCAAAGGCAATTGAGAAGCATGCTGCCCTCCTTTGTGTGTTGGCAGAGGACTGCGACCAACCAGACTACGTTAAGTTGGTCAAAGCATTGTGTGCCGACCACAATGTCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057791362.1
MSGEEPVVVETPVPVAAPTLGEPMDIMTALQLVLKKSLAHGGLVRGLHEGAKAIEKHAALLCVLAEDCDQPDYVKLVKALCADHNVNLISVASAKTLGEWAWLLNCACSCARLILKARPGKLSGLLVLS

XP_057791363.1
MSGEEPVVVETPVPVAAPTLGEPMDIMTALQLVLKKSLAHGGLVRGLHEGAKAIEKHAALLCVLAEDCDQPDYVKLVKALCADHNVNLISVASAKTLGEWAWLLNCACSCARLILKARPGKLSGLLVLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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