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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004634`

染色体: Chr02 坐标: 68806316-68807995 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004634`
名称	SmilChr02G004634
描述	oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68806316 - 68807995 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008628`
GeneID	`131008628`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008628`
原始查询	`SmilChr02G004634`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic-like
产物	oxygen-evolving enhancer protein 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G50820` (PSBO2) photosystem II subunit O-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824246] identity=75.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0501800` (PsbO) - identity=80.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0010207 (photosystem II assembly); GO:0010242 (oxygen evolving activity); GO:0042549 (photosystem II stabilization)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01716 (MSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008628

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791551.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057791551.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057791551.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791551.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791551.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68806563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:68807304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:68807410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B57,C10
`Chr2:68807458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr2:68807462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B32
`Chr2:68807595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C29
`Chr2:68807612`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A13
`Chr2:68807612`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A13
`Chr2:68807884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791551.1

323 aa

162

323

MSP

PF01716 MSP 89-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791551.1`	Pfam	`PF01716`	MSP	Family	89	321	6.5e-98	327.5	Manganese-stabilising protein / photosystem II polypeptide

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935568.1
AGTAAGAAAAAGGCGAGGTGGGACACATGTTGAGATGGGTACGAATGAAAGAAGGGCTTATCCTATCTCTTATCTTTGAAACACGAAAGCCACCAACGCTAGATTTGTCGACACCCATACAATAACAGATTCAGAGTGGTAAGCAGCAGAATCATCAGAGAAAATGGCAGCCCCATCGCTACAGGCGGTCGCCACTTTGATGCAACCAACCAAGCTTGGCCGCCAACTCCGCCCTGTCCAAGGCGTCGGCAAGGCCTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008628
ATGGCAGCCCCATCGCTACAGGCGGTCGCCACTTTGATGCAACCAACCAAGCTTGGCCGCCAACTCCGCCCTGTCCAAGGCGTCGGCAAGGCCTTCGGCGTCGAGCCCTCCGCCGCCAGACTGACTTGCTCTCTTCACGACTTTGCTCAGAAATGCACCGATGCTGCCAAGATTGCTGGCTTCGCTCTCGCAACCTCCGCCCTTGTCGTCTCGGGAGCAAATGCGGAAGGAGTGCCGAAGAGGCTAACCTTCGACGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791551.1
MAAPSLQAVATLMQPTKLGRQLRPVQGVGKAFGVEPSAARLTCSLHDFAQKCTDAAKIAGFALATSALVVSGANAEGVPKRLTFDEIQSKTYLEVKGSGTANQCPTIEGGVDKFAFKAGKYNAKKLCLEPTSFTVKAEGVSKNSPADFQKTKLMTRLTYTLDEIEGPLEVSADGTLNFVEKDGIDYAAVTVQLPGGERVPFLFTIKNLVASGKPDSFGGEFLVPSYRGSSFLDPKGRGGSTGYDNAVALPAGGRGDEEEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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