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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004653`

染色体: Chr02 坐标: 68959571-68961606 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004653`
名称	SmilChr02G004653
描述	aspartic proteinase nepenthesin-1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68959571 - 68961606 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008648`
GeneID	`131008648`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008648`
原始查询	`SmilChr02G004653`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase nepenthesin-1
产物	aspartic proteinase nepenthesin-1
Arabidopsis	`AT2G03200` (AT2G03200) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814849] identity=59.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0448300` - identity=56.1; qcov=0.945; evalue=6.24e-158; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0005576 (extracellular region); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008648

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057791586.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791586.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791586.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791586.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68959870`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr2:68959870`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr2:68959973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D11
`Chr2:68960021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:68960093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,D4
`Chr2:68960238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C43
`Chr2:68960239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,D10
`Chr2:68960381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B137,B50,C12,C23
`Chr2:68960438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C82,D11
`Chr2:68960444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C43
`Chr2:68960517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C87
`Chr2:68960549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791586.1

439 aa

220

439

Asp

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF00026 Asp 96-148 aa PF14543 TAXi_N 96-258 aa PF00026 Asp 168-431 aa PF14541 TAXi_C 284-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791586.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	96	148	1.7e-22	81.0	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057791586.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	96	258	4.5e-50	171.0	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057791586.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	168	431	1.7e-22	81.0	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057791586.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	284	432	1.6e-35	123.0	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935603.1
AACTGTCGGATGGGCAATTCACGATTAAAGAATTTAGTCTTGAATCCGCCGGTAGTTTAAAGTTAAAAAATAGTTACTAATTTTTTTATTTTGTGATTTTTATCTTTCTATATGAAAATAGCAGTTTTAATATGTTAATTCACTCTAAATTATTTAAACACAAAATTAGCTTATACTTGTGGTAGGGTTTGTCATCATGCTTCACTAGTTAAGCTTCTATAGTTCCAACCACCACCCTCAAGACTAGGATGAAATTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008648
ATGCATTCTTCAATGACAATAACCCTACTTGTCACCCTAATGGTCTTCCTCATCCCACCAGCCACCTCCACTTCTCGGCACTCCCTCGACCACCGCCGCCCCGACGCCAAAACCGGGTTCGAGGTGACGCTGAAACACGTGGATTCCGGCGGGAACTTCACCAAGCTGGAGCTCCTCCAGCGCCGGATGAAGCGGGGGAGGAAGAGGATGGAGCGCCTCTACGCAATGGCCCTCGCCGCATCCGACCCCAGCGTCTCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791586.1
MHSSMTITLLVTLMVFLIPPATSTSRHSLDHRRPDAKTGFEVTLKHVDSGGNFTKLELLQRRMKRGRKRMERLYAMALAASDPSVSAPIHPGNGEFLMDISIGTPPASYSAILDTGSDLIWTQCKPCKQCFSSPNPIFDPKKSSSFANLPCSSDLCAALPLSSCGSASACEYLYTYGDYSSTQGVMATETFTFGKVSVPKVGFGCGLDNEGGGFNQGGGLVGLGRGPLSLVSQLDEPKFSYCLTSIDSTKTSTLLMGSLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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