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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004660`

染色体: Chr02 坐标: 69002931-69006333 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004660`
名称	SmilChr02G004660
描述	probable Histone-lysine N-methyltransferase ATXR5
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69002931 - 69006333 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008653`
GeneID	`131008653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008653`
原始查询	`SmilChr02G004660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable Histone-lysine N-methyltransferase ATXR5
产物	probable Histone-lysine N-methyltransferase ATXR5
Arabidopsis	`AT5G09790` (ATXR5) TRITHORAX-RELATED PROTEIN 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830839] identity=61.5; qcov=0.994; evalue=4.26e-154; confidence=high
Rice	`Os01g0965500` (OsSET6) - identity=61.2; qcov=0.907; evalue=1.57e-138; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil00310 (Lysine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00628 (PHD); PF00856 (SET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791594.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791594.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791594.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791594.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791594.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69003077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C3
`Chr2:69003138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:69005108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:69005127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:69005158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B122,B33,B40,B45
`Chr2:69005707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:69005731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C43
`Chr2:69005984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:69005989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,D11
`Chr2:69006010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B33,B40,B45,B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791594.1

353 aa

176

353

PHD

SET

PF00628 PHD 36-80 aa PF00856 SET 236-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791594.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	36	80	4.4e-10	40.1	PHD-finger
`XP_057791594.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	236	341	6.2e-07	30.6	SET domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935611.1
ATGGCTCGGCCTCGGAAGTACAGGTCGATGAAGGAGATCATGAGGGTGGCGAAGCGGGTGGCGGCGGCGGACGGCAGCGCCGATGAAGATGATGACCATTTGACCTGCGAGCAATGCGGGTCGGGCAATCGGGGCGAGGAGCTGGTGTTGTGCGACAAATGCGACAGAGGATACCACCTGCTTTGCCTCCGCCCGATAATGACCCGGGTTCCAATCGGGCCCTGGTGTTGCCCCGCTTGCTCCGGCGACGATAATCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008653
ATGGCTCGGCCTCGGAAGTACAGGTCGATGAAGGAGATCATGAGGGTGGCGAAGCGGGTGGCGGCGGCGGACGGCAGCGCCGATGAAGATGATGACCATTTGACCTGCGAGCAATGCGGGTCGGGCAATCGGGGCGAGGAGCTGGTGTTGTGCGACAAATGCGACAGAGGATACCACCTGCTTTGCCTCCGCCCGATAATGACCCGGGTTCCAATCGGGCCCTGGTGTTGCCCCGCTTGCTCCGGCGACGATAATCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791594.1
MARPRKYRSMKEIMRVAKRVAAADGSADEDDDHLTCEQCGSGNRGEELVLCDKCDRGYHLLCLRPIMTRVPIGPWCCPACSGDDNLPIKSFRGLNRKKLAGFFKIEQDVLFTRKCTSLQDVKRRRRRGGTLVFQKKRRRLLPYVPSEDPERRLAQMRSLSLALTSSGMEFSNELSYRSGMAPRSANQSKFEIGGMQVLSKEDTETLQYCRAMCKRGEFPPLTVTFDLFEGYTVEVDGPIKDMTIIAEYAGDVDYIKNREK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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