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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004677`

染色体: Chr02 坐标: 69112116-69114911 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004677`
名称	SmilChr02G004677
描述	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 51
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69112116 - 69114911 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008685`
GeneID	`131008685`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008685`
原始查询	`SmilChr02G004677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 51
产物	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 51
Arabidopsis	`AT5G64640` (AT5G64640) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836585] identity=58.9; qcov=0.911; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0880300` (OsPME7) - identity=49.2; qcov=0.906; evalue=1.74e-170; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008685

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057791655.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057791655.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791655.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791655.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69112369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:69113678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B65
`Chr2:69113777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:69113804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B84
`Chr2:69113955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B52,C48,C58,C60
`Chr2:69114044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:69114129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr2:69114192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B14,C16,C49
`Chr2:69114225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:69114483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B106
`Chr2:69114489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:69114555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791655.1

561 aa

280

561

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 51-190 aa PF01095 Pectinesterase 250-553 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791655.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	51	190	1.4e-16	61.7	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057791655.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	250	553	4e-117	391.0	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935672.1
CTCAAATTAGTACTATATAATTATATCACTCAACAATTTTCCCCAAGGGAATGCTCAATTAATATTTTTTCTGAAGGGAAATACCCAATCAAATTATATATCCTTTTCAACTTAAGGGGTTGGGGTTGGGTTTCCCTTCCGCATTAAATAAATTCAAACATTTCACCGTCTCTGCTGTGAATTATTGTTCTGAAATTCACGTCGGCATATACAGTAAAACAGTAACTACATACAATGGCGCATTGAAATTGTCAAATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008685
ATGGCTGTAGACGAGAGTCAGCGGAAATCAAAACTCACCGCCATTTTGGTGGTGGTTCTGATCGCCGTGGCTCTCATCCTATTCATCGTCTTCTACAACATCTCCACCCCCTCCCACCACCGCAAATCCACCGTCTATTCCAACGACGCCGTCATCCACGGCGTCTGCACGGCGACGCGGGACCCCTCCGCGTGCAAGGCCTCGCTCAAGTCGGAGTGGCGGGCGGGCGCCACCCCGGGCCCCGCCACCGCGCTGCAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791655.1
MAVDESQRKSKLTAILVVVLIAVALILFIVFYNISTPSHHRKSTVYSNDAVIHGVCTATRDPSACKASLKSEWRAGATPGPATALQAINVTLRVSTRHLHAAIDTVGKILDGSSDNQNRSDTSRLCLEVLRYSDERAAMAADALPGGRIKDARAWMSAALAYHYGCMSGLKNVNDTPLVAAAVEFFNTTLINSTVDVLDMMANYDYFGEEIGSWGPPQTERDGFWPTPGHAASSGNAALGGVPAGMAPNVTVCGGGGGCD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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