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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004733`

染色体: Chr02 坐标: 69561938-69565212 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004733`
名称	SmilChr02G004733
描述	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69561938 - 69565212 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008722`
GeneID	`131008722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008722`
原始查询	`SmilChr02G004733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
产物	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
Arabidopsis	`AT3G01590` (AT3G01590) Galactose mutarotase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821108] identity=76.3; qcov=0.908; evalue=4.73e-156; confidence=high
Rice	`Os04g0658000` (24K23.3) - identity=63.5; qcov=0.922; evalue=1.16e-128; confidence=high
GO	GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0016853 (isomerase activity); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01263 (Aldose_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791722.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791724.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057791722.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791722.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69563422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C63,D2
`Chr2:69563456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B1,B93,C2
`Chr2:69563676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B93
`Chr2:69564168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B36,C42
`Chr2:69564184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B36,B39,C42
`Chr2:69564192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B24,B36,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791722.1

311 aa

156

311

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 18-286 aa

XP_057791723.1

311 aa

156

311

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 18-286 aa

XP_057791724.1

306 aa

153

306

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 23-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791722.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	18	286	1.4e-55	189.5	Aldose 1-epimerase
`XP_057791723.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	18	286	1.4e-55	189.5	Aldose 1-epimerase
`XP_057791724.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	23	281	4.7e-53	181.3	Aldose 1-epimerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935740.1
GTTTTATTTTTTATTTTCCCCTCCAAAAAAAAAAAAAAACCGTTTTATTTTTGATAATTTTGTGGGAGGGGTTGGAAACGAACCCATATAAATAAATCGAGCCCGAGGCTGAAGTTGAAGAGGCCCAATTCCAAATTTCAGATCGTACTGAGTGATCACCCGATTCCGTCTGTGTTTCGGCGAACGTTTGCGTAGTTATATTCGATTTTCAGGCGGAGGAAAAGAAAAAGGTACTGCGTGTTGTGAGAAATTTGAAGGAG...

XM_057935741.1
AATAAATCGAGCCCGAGGCTGAAGTTGAAGAGGCCCAATTCCAAATTTCAGATCGTACTGAGTGATCACCCGATTCCGTCTGTGTTTCGGCGAACGTTTGCGTAGTTATATTCGATTTTCAGGCGGAGGAAAAGAAAAAGGTACTGCGTGTTGTGAGAAATTTGAAGGAGAAATTGAGAAAATGGACCGTCAGACGTATAATTTCATCCATGACCGTGATAGTCCGCCGCGGCTTCTTTTGTCGGAGCCCACTGGTTTCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131008722
ATGGACCGTCAGACGTATAATTTCATCCATGACCGTGATAGTCCGCCGCGGCTTCTTTTGTCGGAGCCCACTGGTTTCACTGCGGAGGTTCTCTTATATGGTGCGCAAGTGGTTTCTTGGAAGAATGAGAGAAGACAGGAGTTGCTATTCTTGAGCAGTAAGGCTGTGTGGAATGCGGCAAAAGCCATAAGGGGTGGCATACCAATTTGCTTTCCACAGTTTTCCAATCTTGGTACACTGGAGCAACATGGATTTGCAAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057791722.1
MDRQTYNFIHDRDSPPRLLLSEPTGFTAEVLLYGAQVVSWKNERRQELLFLSSKAVWNAAKAIRGGIPICFPQFSNLGTLEQHGFARNRLWSVDNSPSPLPPITAPSTVDLILKSTEDDLKTWPHRFELRIRISLSAGKLIWIPRVRNTDSKPFSFTFALRNYMPVSDISEVRVEGLETLDYFDHLLQGERCTEQADAITFDGELDRAYLSTPSKIAIIDHERKVTYELRKEAMPDAVVWNPWDKKAKAIPDLGDEDYKT...

XP_057791723.1
MDRQTYNFIHDRDSPPRLLLSEPTGFTAEVLLYGAQVVSWKNERRQELLFLSSKAVWNAAKAIRGGIPICFPQFSNLGTLEQHGFARNRLWSVDNSPSPLPPITAPSTVDLILKSTEDDLKTWPHRFELRIRISLSAGKLIWIPRVRNTDSKPFSFTFALRNYMPVSDISEVRVEGLETLDYFDHLLQGERCTEQADAITFDGELDRAYLSTPSKIAIIDHERKVTYELRKEAMPDAVVWNPWDKKAKAIPDLGDEDYKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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