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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004819`

染色体: Chr02 坐标: 70314036-70316452 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004819`
名称	SmilChr02G004819
描述	glycine-rich RNA-binding protein 3, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70314036 - 70316452 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008809`
GeneID	`131008809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008809`
原始查询	`SmilChr02G004819`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich RNA-binding protein 3, mitochondrial
产物	glycine-rich RNA-binding protein 3%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G61030` (GR-RBP3) glycine-rich RNA-binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836224] identity=65.9; qcov=0.532; evalue=9.16e-51; confidence=medium
Rice	`Os12g0502200` (OsGRP6) - identity=56.3; qcov=0.48; evalue=2.28e-39; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057791845.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057791845.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791845.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791845.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791845.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70314846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:70314868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:70315628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B114,B68,C34,C48
`Chr2:70315655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B60,B79,C4,C75,D1
`Chr2:70315824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,C18,C45
`Chr2:70315867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B79,C75,D1
`Chr2:70315921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B128,C4,C61,D6
`Chr2:70315940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:70315983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B63,B73,B9,C77
`Chr2:70315984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:70316072`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B64
`Chr2:70316072`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791845.1

248 aa

124

248

RRM_1

PF00076 RRM_1 42-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791845.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	42	112	1.4e-24	86.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935862.1
GCTCGTGATCTCTCCATTTGAAGATCCAACGGCTGGCAGCCACCCATACGCTTCCTATATATAGATCCTCCCATTTCTCGTCTACCTGCTAAACCCTCCCATTACTCTAGGGTTTATCATCGCTTTCAACGATCCAAGTACTCCCCATTCCTCTGAAGGTTGTAACAATGGCTTTGTTTAGAAAAGCAGCGAGTATTCTGGGGAGGACTGTGGCCAGCCGGATAAATCAGGAAACATCAGTGCCCAAGCTCTCTATCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008809
ATGGCTTTGTTTAGAAAAGCAGCGAGTATTCTGGGGAGGACTGTGGCCAGCCGGATAAATCAGGAAACATCAGTGCCCAAGCTCTCTATCTTTCAAGCAATAAGATGCATGTCAAGTTCAAGGGTTTTTGTTGGAGGACTTTCTTACAACACAGATGAACAAGGTCTTAGAGAGTCTTTTAATAAATATGGAGAAGTTGTGGATGTAAGGGTGATCGTTGACCGTGAAACTGGGAGATCCAGAGGATTTGGGTTTGTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791845.1
MALFRKAASILGRTVASRINQETSVPKLSIFQAIRCMSSSRVFVGGLSYNTDEQGLRESFNKYGEVVDVRVIVDRETGRSRGFGFVTFTSAEEASAAIQALDQQELHGRTVKVNYANDRPRTGGFGGGGFGGGGGGYGGGGGYGGGGSYGGGGSYGGGGYGGSGGGGYGGSGGYSGGGYGGGAGSGGYPAGGESQTGGDVQNFGGAGGYANDASSGSYGSGVNNFTGVAGEGSYGDEDAPENFADKRG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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