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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004836`

染色体: Chr02 坐标: 70476921-70489757 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004836`
名称	SmilChr02G004836
描述	probable manganese-transporting ATPase PDR2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70476921 - 70489757 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008831`
GeneID	`131008831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008831`
原始查询	`SmilChr02G004836`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable manganese-transporting ATPase PDR2
产物	probable manganese-transporting ATPase PDR2
Arabidopsis	`AT5G23630` (PDR2) phosphate deficiency response 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832428] identity=77.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0402800` - identity=76.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006874 (intracellular calcium ion homeostasis); GO:0015662 (P-type ion transporter activity); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00122 (E1-E2_ATPase); PF23143 (2TM_P5A-ATPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057791881.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057791881.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057791881.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057791881.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70477340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:70477450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,C14,C17,C42
`Chr2:70479191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:70479227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr2:70479239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:70479795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr2:70481201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:70481203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B16,B34,B9,C46
`Chr2:70481275`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	91	A11,A14,A16,A18,A20,A24,A3,A6,A7,B1,B104,B107,B108,B109,B110,B111,B115,B12,B120,B124,B126,B133,B134,B136,B137,B139,B140,B18,B2,B20,B21,B26,B3,B31,B32,B36,B4,B45,B46,B47,B48,B5,B54,B57,B59,B61,B65,B67,B68,B74,B79,B83,B86,B9,B91,B94,B95,B97,B99,C18,C2,C20,C28,C30,C36,C40,C43,C46,C5,C54,C56,C59,C6,C60,C64,C65,C66,C70,C72,C75,C76,C80,C81,C82,C84,C86,C87,D2,D6,D7,D9
`Chr2:70481288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B24
`Chr2:70481403`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	76	A15,A22,A24,A4,A8,B1,B101,B103,B113,B119,B12,B123,B125,B126,B13,B130,B131,B134,B136,B137,B14,B140,B16,B21,B22,B23,B24,B29,B34,B35,B38,B39,B40,B42,B43,B53,B54,B56,B61,B66,B69,B7,B70,B71,B76,B79,B81,B9,B91,B93,B96,C11,C18,C19,C22,C26,C32,C34,C35,C40,C45,C46,C47,C53,C61,C68,C69,C74,C77,C81,C85,D11,D2,D5,D7,D8
`Chr2:70481837`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791881.1

1183 aa

592

1183

2TM_P5A-ATPase

E1-E2_ATPase

PF23143 2TM_P5A-ATPase 20-85 aa PF00122 E1-E2_ATPase 257-385 aa

XP_057791882.1

991 aa

496

991

E1-E2_ATPase

PF00122 E1-E2_ATPase 65-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791881.1`	Pfam	`PF23143`	2TM_P5A-ATPase	Domain	20	85	1.2e-19	70.8	P5A-ATPase, transmembrane helical hairpin
`XP_057791881.1`	Pfam	`PF00122`	E1-E2_ATPase	Domain	257	385	3.5e-13	49.9	P-type ATPase actuator domain
`XP_057791882.1`	Pfam	`PF00122`	E1-E2_ATPase	Domain	65	193	2.6e-13	50.3	P-type ATPase actuator domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935898.1
CATTCGAAATTAAGAAAAATTAAAATTTTATTTTTTTTTCTGGAATTTTGGGGGCTAGGGCAAGCACGCTCAGATTTCAGATTCCACTCCTCTTCGTCTACTACTCCATCGCCAAATCTATTTTTCGATATCTACAACTTCTGAGCTCTCCGTCGTCGTTTTTAAGTTTGAAAGGCGGCGCCACGACGGAGCCTTGACTCTTCTAGTCCGATCTCCTGCGGCGAAGAATCGAAGAGAATTTGTTGTTGGATCGTCAGAAG...

XM_057935899.1
GTTAATGATATTCACCATGCAGATGCTTGCAAGATTACTCCAGCTAAATTTTCTGGCTCTAAAGAAGTTGTGCCGCTTCACTTTCGGAAGCTTCTTCTACATCACCGGGTACAGAAGAGATCTACTTCGATTTCAGGAAGCAACATTTTATTTACTCAGATGAGAAACATACATTCTCTAAACTTCCCTATCCATCCAAGGAAGCAATTGGATATTATCTTAAGAATACCGGTTATGGTACAGAAGCTAAAATTCTTGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008831
ATGTCAAGGTTTCACGTGGGCGGGAAAGTGGTTGATACTGTTGACTTGTTGAGAAAGAGGCATTGGGCATGGCGTTTGGATATGTGGCCTTTTGCGATTCTCTACGGGGTGTGGCTGTCAGCTGCAGTCCCCAGCTTGGATTTCACTGATGCTTGTATTGTTTTGGGCGGCATTTCTGCATTTCACATTCTCGTGTTTCTATTCACCGTTTGGGCCGTGGATTTTAAATGCTTTGTACAATTCTCCAAGGTTAATGATAT...

LOC131008831
ATGAAAGAGCAGATCATGGAACCTTTTTTCGTGTTTCAGGTTTTCTGTGTTGGCCTGTGGTGTTTGGACGAGTATTGGTACTACAGTCTCTTCACTCTATTCATGCTGTTTATGTTTGAATCAACAATGGCAAAAAGCCGTTTAAAGACTTTATCTGAGCTTAGACGTGTAAGAGTGGATAGCCAAATTATGATGGTTTATCGGTGTGGCAAGTGGGTTAAACTCTCTGGGACAGAACTTCTGCCTGGGGATGTTGTATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791881.1
MSRFHVGGKVVDTVDLLRKRHWAWRLDMWPFAILYGVWLSAAVPSLDFTDACIVLGGISAFHILVFLFTVWAVDFKCFVQFSKVNDIHHADACKITPAKFSGSKEVVPLHFRKLAASSTSPGTEEIYFDFRKQHFIYSDEKHTFSKLPYPSKEAIGYYLKNTGYGTEAKILVATEKWGRNVFEYPQPTFQKLMKEQIMEPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSLFTLFMLFMFESTMAKSRLKTLSELRRVRVDSQIMMVYR...

XP_057791882.1
MKEQIMEPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSLFTLFMLFMFESTMAKSRLKTLSELRRVRVDSQIMMVYRCGKWVKLSGTELLPGDVVSIGRSTGLDGEDKSVPADMLILAGSAIVNEAILTGESTPQWKVSVGNRGNDERLSIKRDKAHVLFGGTKILQHTPDKSFHLKAPDGGCVAVVLRTGFETSQGKLMRTILFSTERVTANSWESGLFILFLVVFALIAAGYVLKKGLEDPTRSKYKLLLSCSLIITSVIPPELPME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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