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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004957`

染色体: Chr02 坐标: 71511881-71517933 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004957`
名称	SmilChr02G004957
描述	chromatin structure-remodeling complex protein BSH
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71511881 - 71517933 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009025`
GeneID	`131009025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009025`
原始查询	`SmilChr02G004957`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chromatin structure-remodeling complex protein BSH
产物	chromatin structure-remodeling complex protein BSH
Arabidopsis	`AT3G17590` (BSH) transcription regulatory protein SNF5, putative (BSH) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821025] identity=77.1; qcov=0.959; evalue=1.06e-137; confidence=high
Rice	`Os02g0723700` - identity=63.3; qcov=0.938; evalue=8.76e-108; confidence=high
GO	GO:0000228 (nuclear chromosome); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04855 (SNF5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057792197.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057792197.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792197.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057792197.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71514875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C37,C52
`Chr2:71515723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:71515750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B61
`Chr2:71517520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:71517697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr2:71517703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D11
`Chr2:71517704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792197.1

241 aa

120

241

SNF5

PF04855 SNF5 22-241 aa

XP_057792198.1

241 aa

120

241

SNF5

PF04855 SNF5 22-241 aa

XP_057792199.1

241 aa

120

241

SNF5

PF04855 SNF5 22-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792197.1`	Pfam	`PF04855`	SNF5	Family	22	241	2.3e-36	126.4	SNF5 / SMARCB1 / INI1
`XP_057792198.1`	Pfam	`PF04855`	SNF5	Family	22	241	2.3e-36	126.4	SNF5 / SMARCB1 / INI1
`XP_057792199.1`	Pfam	`PF04855`	SNF5	Family	22	241	2.3e-36	126.4	SNF5 / SMARCB1 / INI1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936215.1
TTGAGTTACAATTTACAATCGACTACTCGAGTGCATATTTTATTATTTAAATTTTACTCACTCAAATCCCCCGACACTCCACCCTCGTCCCTCCGCCGCCGACCCAAAATCTAACCCATCGACCGCCGCTACCTGAATTGCGACCTGCCGCTAATCACAGCCACCTCCATCGCGACCAAATTCCAGGTCCAGCAGTTTCTGCTATATCTTCTTCAAAGCTCCGCGAAGCAATTGGACTTAATAATCATCAAAAGAAAATA...

XM_057936216.1
ATTTAAATTTTACTCACTCAAATCCCCCGACACTCCACCCTCGTCCCTCCGCCGCCGACCCAAAATCTAACCCATCGACCGCCGCTACCTGAATTGCGACCTGCCGCTAATCACAGCCACCTCCATCGCGACCAAATTCCAGGTCCAGCAGTTTCTGCTATATCTTCTTCAAAGCTCCGCGAAGCAATTGGGTGCCTAATTGGACTTAATAATCATCAAAAGAAAATAAGAGAGGCAGCCAGGTAGCAGTGGAGCATGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131009025
ATGAAATCCCACTCTCCATGGAGCACAGCCAGAAACCCAGTCAAGTTCCGGATACCAACAGCAGATAACCTAGTCCCTATACGCCTGGACATCGAAATTGAGGGACAGAGATTTAGAGATGCTTTCATCTGGAACCCTTCTGATCCTGATTCTGAAGTAGTGGTGTTTGCAAAAAGAACAGTGAAAGACTTGAAGCTTCCTCCTGCTTTTGTCACACAGATTGCTCAATCCATACAGACGCAGCTAACTGAATTTCGGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057792197.1
MKSHSPWSTARNPVKFRIPTADNLVPIRLDIEIEGQRFRDAFIWNPSDPDSEVVVFAKRTVKDLKLPPAFVTQIAQSIQTQLTEFRSYEGQDMYTGEKVVPIKLDLRVNSTLIKDHFLWDLNNFESNPEEFAKTFCKDMGIEDPEVGPAIAIAIREQLYEIAVQNVTSARESRINKKGRRGLEHSQASKNSGNAVDLFKLFGSKSSVVRKRKEWDVYEPMIDLLSNDEVDALEAKEERNGR

XP_057792198.1
MKSHSPWSTARNPVKFRIPTADNLVPIRLDIEIEGQRFRDAFIWNPSDPDSEVVVFAKRTVKDLKLPPAFVTQIAQSIQTQLTEFRSYEGQDMYTGEKVVPIKLDLRVNSTLIKDHFLWDLNNFESNPEEFAKTFCKDMGIEDPEVGPAIAIAIREQLYEIAVQNVTSARESRINKKGRRGLEHSQASKNSGNAVDLFKLFGSKSSVVRKRKEWDVYEPMIDLLSNDEVDALEAKEERNGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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