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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004990`

染色体: Chr02 坐标: 71767723-71774778 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004990`
名称	SmilChr02G004990
描述	galactinol synthase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71767723 - 71774778 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009004`
GeneID	`131009004`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009004`
原始查询	`SmilChr02G004990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	galactinol synthase 2-like
产物	galactinol synthase 2-like
Arabidopsis	`AT1G56600` (GolS2) galactinol synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842114] identity=61.6; qcov=0.956; evalue=3.73e-139; confidence=high
Rice	`Os03g0316200` (OsGolS1) - identity=58.8; qcov=1.01; evalue=2.15e-134; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009004

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792169.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057792169.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057792169.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792169.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792169.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71767825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B34
`Chr2:71767836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:71767857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr2:71767873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr2:71767895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B63,B68,C72
`Chr2:71767978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B55,C23
`Chr2:71768987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B68,B97,B98,C72
`Chr2:71769039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:71769087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr2:71769096`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr2:71769096`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B44
`Chr2:71769143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792169.1

319 aa

160

319

Glyco_transf_8

PF01501 Glyco_transf_8 27-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792169.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	27	261	7.5e-39	134.5	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936186.1
TCTTTCTATCTTATATACATACGGAGTGCTACAAACAATCTCCTCATCCAATTAAACTCTGCGTTGCAATATATATTTATTACAAAACCAGAAATGGCTCCCGAGATTGTGAAATCAACGGTCGGAAATGCGGATGCGCCGGTGGTGGGCGGTCCTCGGCATGCCTACGTCACGTTCTTGGCCGGCGACGGCGACTACGTGAAAGGCGTCGTTGGGTTGGCCAAGGGTTTGAGGAAAGTCGGCGCTGCTTTCCCGCTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009004
ATGGCTCCCGAGATTGTGAAATCAACGGTCGGAAATGCGGATGCGCCGGTGGTGGGCGGTCCTCGGCATGCCTACGTCACGTTCTTGGCCGGCGACGGCGACTACGTGAAAGGCGTCGTTGGGTTGGCCAAGGGTTTGAGGAAAGTCGGCGCTGCTTTCCCGCTCGTCGTGGCGGTCCTTCCCGACGTCCCGGCGGACCACCGCCGTCTCCTGGTGGCGCAGGGCTGTATCCTCCGTGAGATTCAGCCGGCGTCCCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792169.1
MAPEIVKSTVGNADAPVVGGPRHAYVTFLAGDGDYVKGVVGLAKGLRKVGAAFPLVVAVLPDVPADHRRLLVAQGCILREIQPASPPARADAHHNTYVRNYFVLNYCKLRLWEFVEYERMIYMDADVQVFDNIDHLFELPSGYFYGVVDCVCEMYGRPCAQKLRWPEELGPQPPYYLNGGMFIFEPNLNTYHHLIQTLKLTPPTPFAEQDFLNMFFRENMKAIPPMYNLLVAMLWRHPEAADVEAAKVVHYCVAGSKPWR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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