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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005284`

染色体: Chr02 坐标: 73881104-73881963 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005284`
名称	SmilChr02G005284
描述	photosystem II repair protein PSB27-H1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73881104 - 73881963 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009314`
GeneID	`131009314`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009314`
原始查询	`SmilChr02G005284`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem II repair protein PSB27-H1, chloroplastic
产物	photosystem II repair protein PSB27-H1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G03600` (PSB27) photosystem II family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839449] identity=60.8; qcov=1.03; evalue=8.08e-66; confidence=high
Rice	`Os03g0333400` - identity=68.4; qcov=0.777; evalue=5.02e-61; confidence=high
GO	GO:0009523 (photosystem II); GO:0009543 (chloroplast thylakoid lumen); GO:0010206 (photosystem II repair); GO:0010207 (photosystem II assembly)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13326 (PSII_Pbs27)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009314

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057792596.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057792596.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057792596.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792596.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792596.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73881291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C47,C48
`Chr2:73881454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C16,C45
`Chr2:73881554`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	B105,B118,B134,B135,B136,B53,B60,C1,C12,C20,C25,C35,C43,C6,C71,C77,C86
`Chr2:73881557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B42,B43,C11,C69
`Chr2:73881604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B28,C39
`Chr2:73881648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr2:73881659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C2,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792596.1

175 aa

175

PSII_Pbs27

PF13326 PSII_Pbs27 47-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792596.1`	Pfam	`PF13326`	PSII_Pbs27	Family	47	171	8.7e-33	114.3	Photosystem II Pbs27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936613.1
ATACCAATTTTTTTTAGCTTTCTTAGTTGAGCATTGGATCTACTTACGACATGTCATTGAACAAGCAGAATATCATTGGATCTCTCCTCATCCAAAAACAAACTACGAGATAAGGCGATAAGCCCACGTGGCAAATTGACCAAACCAATATCACATCTTCTCTCACCAAAACCACACTCTCTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCCACCCATCCCATGGCTTCTCTAATCACCCCCACCACCGCCGCCGCCGCCACCGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009314
ATGGCTTCTCTAATCACCCCCACCACCGCCGCCGCCGCCACCGCCACCACCCCAAAACCCCTAACACCACCTCTCCGATCACGAGCCACCGCCGCCGCATCCGCCAACAACCTCACCCCCTCCACCGCCGTGGCGCGCCGCCGCAACTTTCTCTCTCTATCCGCCCTCGCGCTGTTCCTGGCGCCCGCCGCCGCGCCGGCGCTGGCGGCCTCCGACGAGGAATACGTGAAGGAGACGGAGGAGGTGATCAACAAGGTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792596.1
MASLITPTTAAAATATTPKPLTPPLRSRATAAASANNLTPSTAVARRRNFLSLSALALFLAPAAAPALAASDEEYVKETEEVINKVRTTISLDKTDPNIATAVAELRETSNTWVAKYRREKALLGRASFRDMYSALNAVSGHYISFGPTAPIPVKRKQRILEEVETAEKALLRGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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