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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005317`

染色体: Chr02 坐标: 74047416-74050390 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005317`
名称	SmilChr02G005317
描述	cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74047416 - 74050390 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009300`
GeneID	`131009300`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009300`
原始查询	`SmilChr02G005317`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit 1, chloroplastic
产物	cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G03280` (PETC) photosynthetic electron transfer C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827996] identity=71; qcov=0.859; evalue=3.09e-99; confidence=high
Rice	`Os07g0556200` (petC) - identity=72.4; qcov=0.848; evalue=2.89e-118; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0045158 (GO:0045158); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00355 (Rieske); PF25471 (TM_PetC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009300

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057792580.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057792580.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057792580.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792580.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74048318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:74048348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C80
`Chr2:74048544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C74,D11,D6
`Chr2:74048554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr2:74049675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,D5
`Chr2:74049732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:74049768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B42,B43,C81
`Chr2:74050041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B68,B93
`Chr2:74050053`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B102,B34
`Chr2:74050053`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B102,B34
`Chr2:74050069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:74050094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792580.1

269 aa

134

269

TM_PetC

Rieske

PF25471 TM_PetC 97-144 aa PF00355 Rieske 176-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792580.1`	Pfam	`PF25471`	TM_PetC	Domain	97	144	1.8e-24	86.0	Iron-sulfur subunit PetC transmembrane anchor
`XP_057792580.1`	Pfam	`PF00355`	Rieske	Domain	176	236	3.9e-10	40.2	Rieske [2Fe-2S] domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936597.1
ATGTTGACACGAGTCACACGATAGAAATTTGATCTGTACGATTTGCAAATCCTAGACTCCCAGGGCCTTTCTAATAAGTTCTATCGTTTGAGCTACTTCTGAAGATTTCATTTTATTTAAAATTGAGCCATGTAGCTTGGCAAATGCATCATGAATTGAAAATTATGATGAGATAATTTTCAGTCATAAAAAATAAAAAAATCATTTAGTAATTGAAAATATGAATTTGAAAATTATGACATCCCAACGTGTGGCTCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009300
ATGAATTTGAAAATTATGACATCCCAACGTGTGGCTCACATGATCATATCACCTTATCTAGCGGGCTTGTGGTGCTCACTTCACTCGATCACTTCACCTTGCTCAAAATCCCACTCCTTCCACACAAACCTCACAACAATGGCTTCCTCAACTACGCTCTCCCCCGCCATCGCCCCTTCTCAGCTGTGCTCCGGGAAGAATGGGATGAACCGATGCGCGAACGTGGCGGTGGCGAAGCTCGGGAAGGGAAAGGGGATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792580.1
MNLKIMTSQRVAHMIISPYLAGLWCSLHSITSPCSKSHSFHTNLTTMASSTTLSPAIAPSQLCSGKNGMNRCANVAVAKLGKGKGMKVRCMATSVPADRVPDMGKRELMNLLLLGAISLPSVGMLLPYTYFFVPPGSGGDGGGTPAKDALGNDVVAVEWLKTHGPGDRTLTQGLKGDPTYLVVENDRTLATYGINAVCTHLGCVVPWNKAENKFMCPCHGSQYNNQGKVVRGPAPLSLALAHADLDDGKVIFVPWVETDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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