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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005338`

染色体: Chr02 坐标: 74228095-74239539 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005338`
名称	SmilChr02G005338
描述	histone-lysine N-methyltransferase ATXR3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74228095 - 74239539 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009190`
GeneID	`131009190`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009190`
原始查询	`SmilChr02G005338`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone-lysine N-methyltransferase ATXR3
产物	histone-lysine N-methyltransferase ATXR3
Arabidopsis	`AT4G15180` (SDG2) SET domain protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827183] identity=50.2; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0180100` (OsSET27) - identity=70.8; qcov=0.232; evalue=0; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil00310 (Lysine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00856 (SET); PF19633 (SDG2_C); PF25531 (GYF_ATXR3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009190

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792423.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792423.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792423.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792423.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74228900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C48,C73,D2
`Chr2:74229455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr2:74229641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B32,B37,B74,B94
`Chr2:74229717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:74229740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B74,B94
`Chr2:74229888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:74229900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:74229915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B16
`Chr2:74229922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:74229935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:74229944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:74229975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792423.1

2362 aa

1181

2362

GYF_ATXR3

SET

SDG2_C

PF25531 GYF_ATXR3 590-637 aa PF00856 SET 1821-1933 aa PF19633 SDG2_C 1944-2362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792423.1`	Pfam	`PF25531`	GYF_ATXR3	Domain	590	637	1.1e-34	119.2	Histone-lysine N-methyltransferase ATXR3, GYF domain
`XP_057792423.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	1821	1933	3.1e-13	50.8	SET domain
`XP_057792423.1`	Pfam	`PF19633`	SDG2_C	Domain	1944	2362	6.2e-233	774.0	Protein SET DOMAIN GROUP 2 C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936440.1
CCAAAGCCCAAGCGCTCAACTTGTTTTAACAAACAAAAAAAAAAGCGCTCAAATAAAAAGAAAATACAGAGCGAAAAAAAAACAATCGATTTACAGAGATTCGTCTTCAGCTATTCTTCCTCTCATCAATCGATCCGGTGTCTGCAATTCTCTCAAATCCTTCAATTTCCGAGTCCACTCAGTCGACTCGCCTACTTCTCCGATCCCACCTCGACTCTGCTCCCGCAATTCCAACTCGTAAGTCTTCAGATTCAAAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009190
ATGGGCGATGGCGGTGTTGCATGCGTCCCTTCACAGCATATTATGGAGAAGTTCGCAATTTGCGGGGGCAAGACCAATGGCAACACCAAGCTCAATTCCGTTTCTAAGACTTCCGTCAAGTTGGCTAAAGTGAACCAGAAGATGAAGCCGAAAAAGTACAAGGGAACCGAGTTGGGCACGAACAATTTTGGCAGTTTGAATAACAGAGAAGTTGCTGAGAAGAATGGCAGTGATGATGTTTCTAACGACAACAACAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792423.1
MGDGGVACVPSQHIMEKFAICGGKTNGNTKLNSVSKTSVKLAKVNQKMKPKKYKGTELGTNNFGSLNNREVAEKNGSDDVSNDNNKDEVEEGELGTLPFENGEFVPEKPLRRYEIKSEVEKGEFIPGKYRKGGGEWEKNDWSSSKEDLEKGEFVPDRWCRSDAANKAGDFGYSKARRFDAAKEKGWKNERDWTSPSARERGWRADRESDWSPPPAREKGWKGDRDWTSPSSGKYSSEKELGRSGGSVQNLRKISSRYEAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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