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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005356`

染色体: Chr02 坐标: 74297560-74299580 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005356`
名称	SmilChr02G005356
描述	peroxidase 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74297560 - 74299580 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009263`
GeneID	`131009263`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009263`
原始查询	`SmilChr02G005356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 3
产物	peroxidase 3
Arabidopsis	`AT1G05260` (RCI3) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837028] identity=68.5; qcov=0.985; evalue=3.27e-163; confidence=high
Rice	`Os06g0681600` (prx89) - identity=62.4; qcov=0.93; evalue=6.58e-139; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009263

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057792533.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057792533.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057792533.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792533.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792533.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74297774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C58,D1
`Chr2:74297796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C58,D1
`Chr2:74297809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B20,B98,C39
`Chr2:74297820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C46
`Chr2:74297845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr2:74297902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:74297907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B25,B61,B66
`Chr2:74297976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:74297997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C20,C79,D6
`Chr2:74298068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B40,C33
`Chr2:74298078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:74298107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,C39,C70,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792533.1

329 aa

164

329

peroxidase

PF00141 peroxidase 44-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792533.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	44	287	6.2e-82	275.7	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936550.1
ATGCCTATATGTCCCTATCTAATTAGTTATAGCTTCCTAATCAATCCAAATGGCCTATAAAATCAGTCCATGCATAAGGATTTGGTAAATCAAAACAGTATATAAACATCTCAAATTCGAAGGTGGCTTATCTCAAGATCAATTATACTTCATCAAAACATGGCGAAATTCGGCATTTTCGCAATCGCAACGACGTTGTTGCTGCTAGAGCTACTCGCGGTCGCTACTCATGCCGATCTGGAGGCGAATTTCTACGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009263
ATGGCGAAATTCGGCATTTTCGCAATCGCAACGACGTTGTTGCTGCTAGAGCTACTCGCGGTCGCTACTCATGCCGATCTGGAGGCGAATTTCTACGCGAAATCGTGCCCGAAGGCCGAGAAAATCGTGCAAGATTACGTCTACAAGCACATCCCGAATGCCCCTTCTCTTGCGGCCGCCCTTATTAGAATGCATTTCCACGATTGCTTCGTGAGGGGATGTGATGCGTCAGTGCTGCTTAACACGACTGCGAGCACGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792533.1
MAKFGIFAIATTLLLLELLAVATHADLEANFYAKSCPKAEKIVQDYVYKHIPNAPSLAAALIRMHFHDCFVRGCDASVLLNTTASTGNQTERVAIPNQTLRGFGFIDGVKALLEAECPGVVSCADVIALVARDSVVATGGPFWNVPTGRRDGVISNASEALAQIPAPTSNFTTLQTDFANKGLDLKDLVLLSGAHTIGISHCTSFDTRLYNFTGVGDQDPALDSEYAANLKANKCKFINSTVIVEMDPGSFRTFDLSYYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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