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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005440`

染色体: Chr02 坐标: 74789115-74796886 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005440`
名称	SmilChr02G005440
描述	fatty acid hydroperoxide lyase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74789115 - 74796886 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009401`
GeneID	`131009401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009401`
原始查询	`SmilChr02G005440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fatty acid hydroperoxide lyase, chloroplastic
产物	fatty acid hydroperoxide lyase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G15440` (HPL1) hydroperoxide lyase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827215] identity=51.5; qcov=0.807; evalue=1.87e-141; confidence=high
Rice	`Os02g0110200` (HPL3) - identity=47.2; qcov=0.992; evalue=4.92e-140; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057792693.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057792693.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057792693.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057792693.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792693.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74789280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:74789315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B25,C81,D1
`Chr2:74789349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C73
`Chr2:74789541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B74,C72
`Chr2:74789556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C4
`Chr2:74789574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B11,B45,C49
`Chr2:74789604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B35,B84,C27,C79
`Chr2:74789646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr2:74789666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:74789709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B48
`Chr2:74789729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:74789742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792693.1

483 aa

242

483

p450

PF00067 p450 314-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792693.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	314	425	3.2e-17	63.2	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936710.1
CTAAACTTTATTTATTTCAAACTCAAATTTCACGTTCTTCAACATTCAAAATAGCTTGAGAAATTTAATTTACTCCACATTCTTCAACATTCAACATATTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCGTGGTGCATAAACGATGAATGTATCACTCTCGAGCTCGGCGGCGCCGCTGACGCCGTCAGCGGCGCCTCAGCGGGCGGCAATCCCCGGCAGCTACGGGTGGCCGGTGATCGGGCCGCTGACGGATCGGCTGCAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009401
ATGAATGTATCACTCTCGAGCTCGGCGGCGCCGCTGACGCCGTCAGCGGCGCCTCAGCGGGCGGCAATCCCCGGCAGCTACGGGTGGCCGGTGATCGGGCCGCTGACGGATCGGCTGCAGTACTTCTGGCTGCAGGGGCCGAAGAATTTCTTCGCGAAGCGGATGGAGAAGTACGGCAGCACGGTGTTCCGCACGAACGTGCCGCCGGCGTTCCCGTTCTTCGCCGGCGTGAACCCCAACGTGGTGGCGGTGCTCGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792693.1
MNVSLSSSAAPLTPSAAPQRAAIPGSYGWPVIGPLTDRLQYFWLQGPKNFFAKRMEKYGSTVFRTNVPPAFPFFAGVNPNVVAVLDVKSFRHLFDMELVEKSNVLVGDFMPSVNYTGGFRVCAYLDTAESKHSQIKDFAIDIIRRSSSTWVSSMATTLDDMWDSLESQLAAAGDGGSVNYIFPLQEFLFAFLSLNILGANASAFPEIKKSGHIMLDKWLAVQLLPTISINVVQPLEEIFLHSFSYPFWLVKSDYEKLASF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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