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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005572`

染色体: Chr02 坐标: 75603621-75605872 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005572`
名称	SmilChr02G005572
描述	nitrile-specifier protein 5
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75603621 - 75605872 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009536`
GeneID	`131009536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009536`
原始查询	`SmilChr02G005572`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nitrile-specifier protein 5
产物	nitrile-specifier protein 5
Arabidopsis	`AT3G07720` (AT3G07720) Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819963] identity=68.2; qcov=0.994; evalue=4.8e-165; confidence=high
Rice	`Os09g0249000` (kr1) - identity=67.5; qcov=1.04; evalue=8.34e-164; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0030234 (enzyme regulator activity); GO:0080028 (nitrile biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01344 (Kelch_1); PF24681 (Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7); PF24981 (Beta-prop_ATRN-LZTR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792917.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792917.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057792917.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057792917.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792917.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75604875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B80,C14
`Chr2:75604929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:75604939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B38,B39,B60
`Chr2:75604958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75605004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:75605014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B108,D5
`Chr2:75605052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:75605082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr2:75605097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B75,C55
`Chr2:75605175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr2:75605213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:75605256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B48,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792917.1

323 aa

162

323

Kelch_1

Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7

Kelch_1

Beta-prop_ATRN-LZTR1

Kelch_1

PF01344 Kelch_1 20-62 aa PF24681 Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7 23-237 aa PF01344 Kelch_1 72-116 aa PF24981 Beta-prop_ATRN-LZTR1 85-163 aa PF01344 Kelch_1 120-163 aa PF01344 Kelch_1 170-210 aa PF01344 Kelch_1 219-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792917.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	20	62	1.8e-50	168.7	Kelch motif
`XP_057792917.1`	Pfam	`PF24681`	Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7	Repeat	23	237	7e-77	258.4	KLHDC2/KLHL20/DRC7 Kelch-repeats domain
`XP_057792917.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	72	116	1.8e-50	168.7	Kelch motif
`XP_057792917.1`	Pfam	`PF24981`	Beta-prop_ATRN-LZTR1	Repeat	85	163	1.3e-44	153.4	Attractin/LZTR1 beta-propeller
`XP_057792917.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	120	163	1.8e-50	168.7	Kelch motif
`XP_057792917.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	170	210	1.8e-50	168.7	Kelch motif
`XP_057792917.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	219	267	1.8e-50	168.7	Kelch motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936934.1
ATTTCAATAATTTTACCGCTATTATTATCCCTTTTTAAAGTAATGTTTTTCCACTGATTTTCATGGAATCTTTTATTTATTCAAATCAAGTGTAAAATACAATCATTTTATTTATATTTATAAAGAAGTCTCAACTTCACTCTCACAAAGCAACAGAAATTCATAGCGTCAGCTGCGAGCAGTGAACAGTAGCTTCTCCATTTTGTTGATCAATGGCTCTTCCGCAAGGCAAATGGGTCAAGCTGGAGCAAAAGGGTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009536
ATGGCTCTTCCGCAAGGCAAATGGGTCAAGCTGGAGCAAAAGGGTGTAGGGCCTGGTGCAAGAAGCTCCCACGCCGTTGCTGTTGTTGGACAGAAGGTGTATGCATTCGGTGGAGAGTTCTCGCCACGAGTCCCTGTGGACAACCACCTCTACGTGTTTGATCTCAGTGATCGGACATGGAGGGTGGCCGATGCCAAGGGCGACATCCCTCCTCCCCGTGTTGGTGTGACGATGGCGTCCATTGCCGAGACCATCTACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792917.1
MALPQGKWVKLEQKGVGPGARSSHAVAVVGQKVYAFGGEFSPRVPVDNHLYVFDLSDRTWRVADAKGDIPPPRVGVTMASIAETIYVFGGRDATHKELNEFYSFDTATDTWTLLSSGPPHRSYHSMTADGRRVYVFGGCGNAGRLNDLWAYDVVDRKWIGFPPPGESCKPRGGPGLAAVQGKIWVVYGFSGEELDDVHCFNPKAGRWSCVETSGEKPTPRSMFSSVSIGKYIFLHGGEIDPSDLGHLGAGKFSKEVYALD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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