当前解析结果
SmilChr02G005585| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005585 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005585 |
| 描述 | probable proteasome inhibitor |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 75660752 - 75663714 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009550 |
|---|---|
| GeneID | 131009550 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009550 |
| 原始查询 | SmilChr02G005585 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable proteasome inhibitor |
| 产物 | probable proteasome inhibitor |
| Arabidopsis | AT3G53970 (AT3G53970)proteasome inhibitor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824564] identity=59.1; qcov=1.02; evalue=1.19e-107; confidence=high |
| Rice | Os07g0548900- identity=45; qcov=1; evalue=6.45e-57; confidence=high |
| GO | GO:0004866 (endopeptidase inhibitor activity); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0070628 (proteasome binding) |
| KEGG | smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF11566 (PI31_Prot_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009550 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057792939.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057792939.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057792939.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057792939.1 |
| 5 | Vesicle | 囊泡 | 0.20000 | XP_057792939.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:75660933 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B54,B66,C45,C51,D5 |
Chr2:75661380 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr2:75662494 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B70,C62 |
Chr2:75662502 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr2:75662518 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr2:75662903 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr2:75662975 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr2:75663191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B123,B68,C5,C71 |
Chr2:75663231 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr2:75663465 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,B53 |
Chr2:75663471 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C56 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792939.1PF11566
PI31_Prot_N 15-152 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792939.1 |
Pfam | PF11566 |
PI31_Prot_N | Family | 15 | 152 | 4.2e-19 | 69.4 | PI31 proteasome regulator N-terminal |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。