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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005593`

染色体: Chr02 坐标: 75688723-75690529 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005593`
名称	SmilChr02G005593
描述	exopolygalacturonase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75688723 - 75690529 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010031`
GeneID	`131010031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010031`
原始查询	`SmilChr02G005593`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exopolygalacturonase-like
产物	exopolygalacturonase-like
Arabidopsis	`AT1G43080` (AT1G43080) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840907] identity=42; qcov=0.961; evalue=2.02e-91; confidence=medium
Rice	`Os01g0623600` (OsPGL32) - identity=40.3; qcov=0.977; evalue=8.82e-92; confidence=medium
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057793407.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057793407.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793407.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793407.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793407.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75688783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,A8
`Chr2:75688812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:75688870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B15,B59,C60,C67
`Chr2:75688890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr2:75688941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C73
`Chr2:75688965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C14
`Chr2:75688993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:75689002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B138,B15,B59
`Chr2:75689012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B87,B88,B9,C5
`Chr2:75689013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr2:75689089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:75689136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B51,B66,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793407.1

389 aa

194

389

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 64-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793407.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	64	374	7e-91	305.4	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937424.1
ATGGATTCAAAGTGGTTGTCTCAAAACATTGTTATTTTCTTTCTCTTAACCATTTTGAACACTCATCATGTCCAATGCCAAACCAACTTATTCTCAATTGTTCAATTTGGTGCCATTTCCGATGCCACAACAAATAGCAAACAGGCATTTTTGAATGCATGGAAGAAAGCTTGTATAATTAATGGAGGCACGATTAGTATTCCAGCAGGAACTTTTCAACTAAGTGATATTGAATTTTTAGGGCCATGCAAAGGCCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010031
ATGGATTCAAAGTGGTTGTCTCAAAACATTGTTATTTTCTTTCTCTTAACCATTTTGAACACTCATCATGTCCAATGCCAAACCAACTTATTCTCAATTGTTCAATTTGGTGCCATTTCCGATGCCACAACAAATAGCAAACAGGCATTTTTGAATGCATGGAAGAAAGCTTGTATAATTAATGGAGGCACGATTAGTATTCCAGCAGGAACTTTTCAACTAAGTGATATTGAATTTTTAGGGCCATGCAAAGGCCAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793407.1
MDSKWLSQNIVIFFLLTILNTHHVQCQTNLFSIVQFGAISDATTNSKQAFLNAWKKACIINGGTISIPAGTFQLSDIEFLGPCKGQTNFVLNGTLIAPTVPTPNLDYWIIFRDVDGLSISGKGTLNGNGASYWKSKQQTFVTSLKLEHVKNAGIRDIHSVNSKKFHFAINNCQGVAITNVGITAPGNSPNTDGIHLQASENIIISNTNIATGDDCISIGDGVTNMNITGINCGPGHGISIGSLGRYPNEKEVKSISVTNC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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