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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005604`

染色体: Chr02 坐标: 75739543-75747635 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005604`
名称	SmilChr02G005604
描述	protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75739543 - 75747635 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009568`
GeneID	`131009568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009568`
原始查询	`SmilChr02G005604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2-like
产物	protein ENHANCED DOWNY MILDEW 2-like
Arabidopsis	`AT5G55390` (EDM2) ENHANCED DOWNY MILDEW 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835632] identity=43.2; qcov=0.945; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os08g0502000` - identity=51.9; qcov=0.348; evalue=4.5e-117; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF22908 (PHD_NSD); PF26055 (Mtase_EDM2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792962.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792962.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792962.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792962.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792962.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75739784`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A1,A10,A25,B11,B139,B31,B35,B42,B43,B48,B5,B61,B64,B65,C3,C31,C34,C35,C37,C40,C43,C45,C47,C63
`Chr2:75740179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr2:75743111`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B44,B75
`Chr2:75743111`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B44,B75
`Chr2:75743707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr2:75743825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:75744056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:75745470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B84,C81
`Chr2:75746623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B140,C11,C19,C69
`Chr2:75747369`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B106,B25,C24
`Chr2:75747369`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B106,B25,C24
`Chr2:75747374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A1,A10,A13,A25,A6,B11,B139,B31,B35,B42,B43,B48,B5,B61,B64,B65,C3,C31,C34,C35,C37,C40,C43,C45,C47,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792962.1

998 aa

499

998

PHD_NSD

Mtase_EDM2

PF22908 PHD_NSD 379-447 aa PF26055 Mtase_EDM2 773-942 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792962.1`	Pfam	`PF22908`	PHD_NSD	Domain	379	447	2.1e-19	70.3	Histone-lysine N-methyltransferase NSD-like, PHD zinc finger
`XP_057792962.1`	Pfam	`PF26055`	Mtase_EDM2	Domain	773	942	2.2e-92	307.9	EDM2 methyltransferase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936979.1
AGTGCAAATATGGGCTGCTATAAGGCCCACTTTGACGATGGATCTCCCAGAAAGCCCAAATCAGAGCAACGTCACGTCACTTCATCTTTTTGGCACTACCACTGCCAACCTGCCAAACCAAATCAGAGCAACCGTACATACTCTCTCACTCTCGACCAACCCAACTCCATACTCTACTCACAACACACGCCGCAAGCCGCGCGCCTGAGCGGGAGGATCACAATATACATCTTCGCTAGAGCCACATTTGCTCTTCCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009568
ATGGGCTGCTATAAGGCCCACTTTGACGATGGATCTCCCAGAAAGCCCAAATCAGAGCAACGTCACGTCACTTCATCTTTTTGGCACTACCACTGCCAACCTGCCAAACCAAATCAGAGCAACCGTACATACTCTCTCACTCTCGACCAACCCAACTCCATACTCTACTCACAACACACGCCGCAAGCCGCGCGCCTGAGCGGGAGGATCACAATATACATCTTCGCTAGAGCCACATTTGCTCTTCCCTGTCGATCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792962.1
MGCYKAHFDDGSPRKPKSEQRHVTSSFWHYHCQPAKPNQSNRTYSLTLDQPNSILYSQHTPQAARLSGRITIYIFARATFALPCRSSMALSDEEGEIALDCATNYFLVDSKENPISFSSLPLIWNDSEGEEHGQRVTAPTEPVYLRGAVHDGCRKIYTKVIGWKFVLSYVLPEIYVLRDSKFGRWIKLHKPRKGYESTVRTALITIHCLHFIKKSSKEISGEDLWKHLGKTFSTYEDPPSENDLASHLQLMKEAALRDKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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