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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000033`

染色体: Chr03 坐标: 411639-417891 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000033`
名称	SmilChr03G000033
描述	isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	411639 - 417891 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016993`
GeneID	`131016993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016993`
原始查询	`SmilChr03G000033`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I-like
产物	isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I-like
Arabidopsis	`AT5G16440` (IPP1) isopentenyl diphosphate isomerase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831505] identity=75.2; qcov=0.992; evalue=1.56e-143; confidence=high
Rice	`Os07g0546000` (IPI) - identity=80.9; qcov=0.927; evalue=2.05e-144; confidence=high
GO	GO:0004452 (isopentenyl-diphosphate delta-isomerase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008299 (isoprenoid biosynthetic process); GO:0009240 (isopentenyl diphosphate biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00293 (NUDIX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801834.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057801834.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057801834.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801834.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057801834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:411723`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	B112,B130,B132,B140,B2,B20,B63,B64,B68,B78,B83,B9,B90,B92,C26,C35,C48,C53,C54,C80,C84,D7
`Chr3:411768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:411806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C70,C9
`Chr3:411807`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C70,C9
`Chr3:411807`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C70,C9
`Chr3:411933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr3:412026`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B124,B73,C20,D2
`Chr3:412026`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B124,B73,C20,D2
`Chr3:417012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:417052`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B134,B29,B30,D9
`Chr3:417052`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B134,B29,B30,D9
`Chr3:417057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B119,B27,B89,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801834.1

248 aa

124

248

NUDIX

PF00293 NUDIX 66-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801834.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	66	200	5.8e-16	59.4	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945851.1
TCTAATCCACACCAACCAAATGTATGTTATATAATCACATTGATTAAGAGCTAAATAATACAAGAAACATGTCATTCTCCTCCTCTACCTTGATCACTACCAACGCCATCCGCAGCCAAGTCTCCTCCTCCGCCATGGATGTTGTTCAAAGACGTCTCATGTTTGAAGACGAGTGTATTTTGGTCGATGAGAATGACGCCGTCGTCGGCCACGACACCAAATACAACTGCCACCTGATGGAAAAGATCAATTCCGAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016993
ATGTCATTCTCCTCCTCTACCTTGATCACTACCAACGCCATCCGCAGCCAAGTCTCCTCCTCCGCCATGGATGTTGTTCAAAGACGTCTCATGTTTGAAGACGAGTGTATTTTGGTCGATGAGAATGACGCCGTCGTCGGCCACGACACCAAATACAACTGCCACCTGATGGAAAAGATCAATTCCGAAAATCTGCTGCACAGATCCTTCAGCGTGTTTCTCTTCAACTCTAAACACGAGTTGCTTCTTCAGCAACGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801834.1
MSFSSSTLITTNAIRSQVSSSAMDVVQRRLMFEDECILVDENDAVVGHDTKYNCHLMEKINSENLLHRSFSVFLFNSKHELLLQQRSATKVTFPLVWTNTCCSHPLYTESELVEADALGVKNAARRKLLDELGIPADDVPLDHFLPLARMLYKAPSDGKWGEHELDHLLFIVRDVRLEPNPDEVADVKYVSREQLQELLRKVDAGEDGLKLSPWFRLIVDNFLFEWWDHVDAGTLAQAADMKTIHKLT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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