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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000051`

染色体: Chr03 坐标: 514695-517585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000051`
名称	SmilChr03G000051
描述	proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	514695 - 517585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016861`
GeneID	`131016861`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016861`
原始查询	`SmilChr03G000051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	proteinaceous RNase P 1%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G32230` (PRORP1) proteinaceous RNase P 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817782] identity=60.6; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0692500` - identity=60.1; qcov=0.729; evalue=2.71e-172; confidence=high
GO	GO:0001682 (tRNA 5'-leader removal); GO:0004526 (ribonuclease P activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13812 (PPR_3); PF16953 (PRORP); PF17177 (PPR_long)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016861

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801622.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057801622.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057801622.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801622.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:514800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C47,C69
`Chr3:514804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B42,B43,B78
`Chr3:514805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C47,C69
`Chr3:514858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:514859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:514942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:514987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr3:515053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:515101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:515129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr3:515154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:515161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C45,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801622.1

564 aa

282

564

PPR_long

PPR_3

PRORP

PF17177 PPR_long 88-289 aa PF13812 PPR_3 154-206 aa PF16953 PRORP 329-556 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801622.1`	Pfam	`PF17177`	PPR_long	Repeat	88	289	1.1e-72	244.5	Pentacotripeptide-repeat region of PRORP
`XP_057801622.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	154	206	1.2e-06	29.2	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057801622.1`	Pfam	`PF16953`	PRORP	Domain	329	556	1.6e-75	254.6	Protein-only RNase P

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945639.1
TCGCAGAAGTTGAGTGAGTAATTCCATCGAGCAGTTGGCGGGCACTTTGTCGCAGTTTCTTGAATTCGAGGATTCAATTTTTAGCAGGGATGATACTCCGCGTGGCGGCGGTCTCACCCAAAACCTCTCTTCTCCTTTCCCACTTCCGCAAGAGCTCCAACACGCTTCTTCTGCATTCTAAATGCTTCAGTTATTTCCGGCAGCACCATACTTGTTCACTGAAGATTATATGCAACGCGAGGGAGCTGCCAAAAAGCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016861
ATGATACTCCGCGTGGCGGCGGTCTCACCCAAAACCTCTCTTCTCCTTTCCCACTTCCGCAAGAGCTCCAACACGCTTCTTCTGCATTCTAAATGCTTCAGTTATTTCCGGCAGCACCATACTTGTTCACTGAAGATTATATGCAACGCGAGGGAGCTGCCAAAAAGCCCCATTTCGATGGAAAGAAAAGCAAGGCATTTCTCCTCCGCTTCCGCTGAGGCTCTCGTAAAAAATTCAACGGATTTGAGCAATCGAATGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801622.1
MILRVAAVSPKTSLLLSHFRKSSNTLLLHSKCFSYFRQHHTCSLKIICNARELPKSPISMERKARHFSSASAEALVKNSTDLSNRMTKKARREAPDMILRVKLDQCSKIGDFAEALRLYEEAKANTVPLNLHHYNVLLYLCSSSGGSFEKGFEIFKQMGVDNVAPNEATFTNISRLAASREDPELAFTLVKQMKNHGIAPKLRSYGPALFGFCNKGMADEAYEVDSHMVESGVSAEEAELSALLRVSSRVEREGKVYEFM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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