当前解析结果
SmilChr03G000372| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000372 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000372 |
| 描述 | F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 4158434 - 4159264 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018133 |
|---|---|
| GeneID | 131018133 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018133 |
| 原始查询 | SmilChr03G000372 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like |
| 产物 | F-box/kelch-repeat protein At3g06240-like |
| Arabidopsis | AT3G06240 (AT3G06240)F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=27.8; qcov=1.02; evalue=4.08e-21; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03478 (Beta-prop_KIB1-4); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018133 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802837.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057802837.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057802837.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802837.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802837.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057802837.1PF08268
FBA_3 3-196 aa
PF03478
Beta-prop_KIB1-4 15-200 aa
PF07734
FBA_1 18-272 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057802837.1 |
Pfam | PF08268 |
FBA_3 | Repeat | 3 | 196 | 2.9e-13 | 50.3 | F-box associated beta propeller domain |
XP_057802837.1 |
Pfam | PF03478 |
Beta-prop_KIB1-4 | Repeat | 15 | 200 | 2.8e-08 | 34.3 | KIB1-4 beta-propeller |
XP_057802837.1 |
Pfam | PF07734 |
FBA_1 | Repeat | 18 | 272 | 2.3e-22 | 80.1 | F-box associated beta propeller domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。