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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000544`

染色体: Chr03 坐标: 5906436-5914549 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000544`
名称	SmilChr03G000544
描述	uncharacterized SmilChr03G000544
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5906436 - 5914549 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017213`
GeneID	`131017213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017213`
原始查询	`SmilChr03G000544`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880]; symbol=AT5G38890; hit=AT5G38890; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880]; symbol=AT5G38890; hit=AT5G38890; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G38890` (AT5G38890) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880] identity=56.2; qcov=0.905; evalue=7.37e-32; confidence=medium
Rice	`Os02g0815800` - identity=54.7; qcov=0.914; evalue=1.15e-29; confidence=medium
GO	GO:0000176 (nuclear exosome (RNase complex)); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006396 (RNA processing)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF14382 (ECR1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801934.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057801934.1`
3	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057801934.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801934.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5906568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B94
`Chr3:5906605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:5906611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:5906618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr3:5906626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B35
`Chr3:5906628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B13,B74,C76
`Chr3:5906634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B118,B126,B64,C49
`Chr3:5906648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C67,D11
`Chr3:5906708`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B112,B45,B77,C70
`Chr3:5906708`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B112,B45,B77,C70
`Chr3:5906718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B23,C39
`Chr3:5906723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B93,C28,C48,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801934.1

116 aa

116

ECR1_N

PF14382 ECR1_N 9-46 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801934.1`	Pfam	`PF14382`	ECR1_N	Domain	9	46	1.6e-08	34.9	Exosome complex exonuclease RRP4 N-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945951.1
CGAATACAGAAAGCAAAGAGCGGCAAATCTGCTGCTTCTCTGAGATCTTCTCCGTTTGCGCCACCGCCACCTGCAAAGAGGAATTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTAAGGAAAAGAATACAATGAAGGAGAGAGAAGAAGAGAATTTCGTGACGCCGGGTGATATGCTGGGGAAAGCTCTAGAGTTGAAACCTGGCTACGGCGCTTACTTCTCGTCCCACGATAAAGCCATATACGCCTCTCTCACTGGATTCCGCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017213
ATGAAGGAGAGAGAAGAAGAGAATTTCGTGACGCCGGGTGATATGCTGGGGAAAGCTCTAGAGTTGAAACCTGGCTACGGCGCTTACTTCTCGTCCCACGATAAAGCCATATACGCCTCTCTCACTGGATTCCGCTCTCTCACTCCTGCCCCTCCCGACTCCGACGACCCGAGGGCGACGGTGGAGGTGAAGGTTCACAAGGCACACGGTCCGGTGCTGGAGCCCGGAGTTGTCGTTACTGCAAGAGTGATGGCTAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801934.1
MKEREEENFVTPGDMLGKALELKPGYGAYFSSHDKAIYASLTGFRSLTPAPPDSDDPRATVEVKVHKAHGPVLEPGVVVTARVMAKMASADIVCIGPKSVREKFTGIIRSCILNLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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