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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000694`

染色体: Chr03 坐标: 7744826-7748324 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000694`
名称	SmilChr03G000694
描述	uncharacterized SmilChr03G000694
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7744826 - 7748324 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017320`
GeneID	`131017320`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017320`
原始查询	`SmilChr03G000694`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027]; symbol=AT1G05270; hit=AT1G05270; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027]; symbol=AT1G05270; hit=AT1G05270; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G05270` (AT1G05270) TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027] identity=40.4; qcov=0.943; evalue=1.87e-65; confidence=medium
Rice	`Os05g0499500` - identity=38.2; qcov=0.96; evalue=3.54e-59; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01963 (TraB_PrgY_gumN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017320

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057802015.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057802015.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057802015.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802015.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802015.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7744914`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B11
`Chr3:7744914`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B11
`Chr3:7744915`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B11
`Chr3:7744915`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B11
`Chr3:7744984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:7745015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B59,B94
`Chr3:7745025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B59,B94
`Chr3:7745037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B59,B94,D2
`Chr3:7745052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B2,B59,B94
`Chr3:7745071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B9
`Chr3:7745096`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B79
`Chr3:7745096`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802015.1

331 aa

166

331

TraB_PrgY_gumN

PF01963 TraB_PrgY_gumN 78-290 aa

XP_057802016.1

297 aa

148

297

TraB_PrgY_gumN

PF01963 TraB_PrgY_gumN 200-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802015.1`	Pfam	`PF01963`	TraB_PrgY_gumN	Family	78	290	1.4e-11	45.4	TraB/PrgY/gumN family
`XP_057802016.1`	Pfam	`PF01963`	TraB_PrgY_gumN	Family	200	256	2.3e-11	44.7	TraB/PrgY/gumN family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946033.1
AGAATGGGCCGACAACCACAAGCCCACATCTCAGTCTAAAATATCGCCCAAAATTTCACCCAAAATCGGAAGTAGCAGAAGATGAACGGATTAAGTCGTCTCAATTCGGCCAATCACCTCTCCGCCGCAGCCGCCGCCGTATATCCGAAACGGTTGCTCAGAACAAGTATCGGTCACTCCTCTCCCGCAGCGACAGCCGGAATTAGTGATACCCGCAATAGTTATGCGAGAAAAAGGGGAAAAAAGCTGAAGGAGCTCTC...

XM_057946032.1
GAATGGGCCGACAACCACAAGCCCACATCTCAGTCTAAAATATCGCCCAAAATTTCACCCAAAATCGGAAGTAGCAGAAGATGAACGGATTAAGTCGTCTCAATTCGGCCAATCACCTCTCCGCCGCAGCCGCCGCCGTATATCCGAAACGGTTGCTCAGAACAAGTATCGGTCACTCCTCTCCCGCAGCGACAGCCGGAATTAGTGATACCCGCAATAGTTATGCGAGAAAAAGGGGAAAAAAGCTGAAGGAGCTCTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017320
ATGAACGGATTAAGTCGTCTCAATTCGGCCAATCACCTCTCCGCCGCAGCCGCCGCCGTATATCCGAAACGGTTGCTCAGAACAAGTATCGGTCACTCCTCTCCCGCAGCGACAGCCGGAATTAGTGATACCCGCAATAGTTATGCGAGAAAAAGGGGAAAAAAGCTGAAGGAGCTCTCGAGGAGTGTGGTGATGCTCACTTGTGACTCATCTGCAGACGGAGGCGTCTGCAATGTTTATTTGGTCGGATCCAATCACCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802015.1
MNGLSRLNSANHLSAAAAAVYPKRLLRTSIGHSSPAATAGISDTRNSYARKRGKKLKELSRSVVMLTCDSSADGGVCNVYLVGSNHHCPKYWEEVRATVQFLKPEVVFLELCSKRNGILMRKNPKVPTMREMAEMWKQNHKLSWILYYWCMTKRGSRFEHTICGDFRAANEEAKKYGAKVILGDRPIHITDQRYIAKTSIWQFLTVQTQGVRTKLPNDLKQKLNGKYDAHAWDQYHQETAKSDPAWAEIYGHERDQYISA...

XP_057802016.1
MNGLSRLNSANHLSAAAAAVYPKRLLRTSIGHSSPAATAGISDTRNSYARKRGKKLKELSRSVVMLTCDSSADGGVCNVYLVGSNHHCPKYWEEVRATVQFLKPEVVFLELCSKRNGILMRKNPKVPTMREMAEMWKQNHKLSWILYYWCMTKRGSRFEHTICGDFRAANEEAKKYGAKVILGDRPIHLNGKYDAHAWDQYHQETAKSDPAWAEIYGHERDQYISAKILDVARDHKSVVAVVGKAHLPGIQKNWKQPVDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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