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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001138`

染色体: Chr03 坐标: 13099537-13103091 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001138`
名称	SmilChr03G001138
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13099537 - 13103091 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017537`
GeneID	`131017537`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017537`
原始查询	`SmilChr03G001138`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 5-like
Arabidopsis	`AT4G33830` (AT4G33830) Glycosyl hydrolase family 10 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829525] identity=42.9; qcov=0.964; evalue=3e-149; confidence=medium
Rice	`Os03g0201901` - identity=41.5; qcov=0.918; evalue=1.98e-142; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10); PF02018 (CBM_4_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017537

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057802308.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057802308.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802308.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802308.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13099553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:13099705`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	B135,B31,B35,B46,B50,B6,B60,B93,C10,C2,C21,C48,C58,C61,C64,C66,C67,C83
`Chr3:13099713`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr3:13099808`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A5,B109,B37,B54,B62,B63,B7,B82,B83,B88,C3,C32,C34,C43,C77,C83
`Chr3:13099845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr3:13099847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B60
`Chr3:13099848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C30
`Chr3:13099862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:13099874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B85,C85
`Chr3:13099888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:13099900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B41,C10,C74
`Chr3:13099904`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	20	A9,B109,B37,B62,B63,B7,B8,B82,B83,B88,B97,C3,C32,C34,C42,C43,C47,C60,C68,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802308.1

583 aa

292

583

CBM_4_9

Glyco_hydro_10

PF02018 CBM_4_9 44-161 aa PF00331 Glyco_hydro_10 223-483 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802308.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	44	161	8.8e-09	36.6	Carbohydrate binding domain
`XP_057802308.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	223	483	7.8e-34	118.0	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946325.1
AATGGCTTTTCTCACTGTTTTCACTCTATTATCTCTTTTCTTTGGTTTTGAAGTGCATGCGGTGCCCTATGATTACTCATACACACTTGGGTGTGTGGCGAAGCCCAAGCCGCCGCAATACTATGGAGGAATCGCCGTGAATTCGGAATTCGACGACGGATTGACGGGATGGGCAGCAGTTGGAAACGCTGCAATAGCCACTGCCAAGTCGCCGTGCGGCAATAGCTACGCCGTCGTTTCCGGCATTCGCACGCCGCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017537
ATGGCTTTTCTCACTGTTTTCACTCTATTATCTCTTTTCTTTGGTTTTGAAGTGCATGCGGTGCCCTATGATTACTCATACACACTTGGGTGTGTGGCGAAGCCCAAGCCGCCGCAATACTATGGAGGAATCGCCGTGAATTCGGAATTCGACGACGGATTGACGGGATGGGCAGCAGTTGGAAACGCTGCAATAGCCACTGCCAAGTCGCCGTGCGGCAATAGCTACGCCGTCGTTTCCGGCATTCGCACGCCGCGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802308.1
MAFLTVFTLLSLFFGFEVHAVPYDYSYTLGCVAKPKPPQYYGGIAVNSEFDDGLTGWAAVGNAAIATAKSPCGNSYAVVSGIRTPRSDGISQAFNVDRDILYTVSAWFQVSVGEAAVQVKIVTSAGNRTANWITAKAGCWTMLKGGFHVKVTEAAELHFETNSTGFDMWVDSISVQPFMQEEWTRHQALSLEKVRKGKVRFEVVDSLENPVADAAVLIKQHEPHFPFGCNMNRLILDSQAYQRWFLEKRFKYSVFENELK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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