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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001289`

染色体: Chr03 坐标: 15116206-15119938 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001289`
名称	SmilChr03G001289
描述	persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15116206 - 15119938 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017797`
GeneID	`131017797`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017797`
原始查询	`SmilChr03G001289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial-like
产物	persulfide dioxygenase ETHE1 homolog%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G53580` (GLY3) glyoxalase II 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841793] identity=83.9; qcov=0.826; evalue=4.06e-158; confidence=high
Rice	`Os01g0667200` (GLYII-1) - identity=77.6; qcov=0.84; evalue=3.9e-149; confidence=high
GO	GO:0006749 (glutathione metabolic process); GO:0050313 (sulfur dioxygenase activity); GO:0070813 (hydrogen sulfide metabolic process)
KEGG	smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00753 (Lactamase_B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017797

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057802505.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057802505.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802505.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802505.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15116668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C33
`Chr3:15116677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B58,C31,C63,C67
`Chr3:15116744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B102
`Chr3:15117486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr3:15117539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr3:15117885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:15118555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:15118564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:15118606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:15118607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C17
`Chr3:15119137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B24,B53,C61
`Chr3:15119241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B136,B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802505.1

293 aa

146

293

Lactamase_B

PF00753 Lactamase_B 62-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802505.1`	Pfam	`PF00753`	Lactamase_B	Domain	62	230	1.7e-14	54.9	Metallo-beta-lactamase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946522.1
AGAAAGTGCAATGGGGATTTATTGGAGAAGCGATATGCTAATATCTCTGTATTCGTCGCTCACTCTTGTAAATGCCGAAACTACCAATGGCGTAATCCCAAGCAACCACTCCAATTCCCTAATTCCCCCGATCATTGCAATCCCTAAATATAATTTATTCATTCTTTGTCAGACTTTCAATTTAGTATTGATTTATCCAATGACGCATCCTCACCACGCACTTCGAGTGCAGATAGGATTACTGCATAGTATATTGGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017797
ATGCTGTCCAAATTCCAATTATTGAAAATTTCAGCCACATTTTCTGCTCCCACACTTCCAAAGAAGTCTTCTTTCCAGCAGATTGTTACGTTCACGGCCAAGTTTGGATCGCGAATGGGGTCGGCTTCCTATACGACGTCGTCCAAGTTGCTTTTTCGGCAGCTCTTTGAGAAGGAGTCCTCCACCTACACTTACCTTCTCGCTGATGCTTCTCACCCGGATAAACCAGCTCTGTTGGTAGACCCAGTAGACAAGACCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802505.1
MLSKFQLLKISATFSAPTLPKKSSFQQIVTFTAKFGSRMGSASYTTSSKLLFRQLFEKESSTYTYLLADASHPDKPALLVDPVDKTVDRDVSLVKELGLKLIYAINTHVHADHVTGTGLLKSKVPGVKSIISKASNAKADLFVEPGDKIYFGDLFLEVRATPGHTQGCVTYVTGDGPDQPQPRMAFTGDALLIRGCGRTDFQGGSSDQLYDSVHSQIFTLPKDTFVYPAHDYKGFSATTVAEEMQYNPRLTKDKETFKNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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