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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001409`

染色体: Chr03 坐标: 16722149-16723906 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001409`
名称	SmilChr03G001409
描述	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16722149 - 16723906 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018470`
GeneID	`131018470`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018470`
原始查询	`SmilChr03G001409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit-like
产物	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit-like
Arabidopsis	`ATCG00670` (clpP) ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844734] identity=86.2; qcov=0.76; evalue=1.54e-110; confidence=high
Rice	`Os02g0634500` (OsCLP3) - identity=41.6; qcov=0.755; evalue=1.91e-45; confidence=medium
GO	GO:0004176 (ATP-dependent peptidase activity); GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006515 (protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins); GO:0009368 (endopeptidase Clp complex); GO:0051117 (ATPase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00574 (CLP_protease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018470

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057803171.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057803171.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057803171.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803171.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803171.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16722152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:16722171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C19,C39,C46,C74,C82
`Chr3:16722587`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	47	A13,A15,A18,A25,A6,A8,B10,B100,B106,B110,B119,B127,B133,B136,B137,B138,B140,B17,B27,B28,B32,B38,B39,B46,B52,B62,B63,B65,B74,B82,B94,B95,C34,C35,C36,C37,C39,C40,C41,C65,C7,C73,C75,C85,C9,D3,D9
`Chr3:16722796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B81,C48,C82,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803171.1

229 aa

114

229

CLP_protease

PF00574 CLP_protease 54-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803171.1`	Pfam	`PF00574`	CLP_protease	Domain	54	227	1.2e-63	215.0	Clp protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947188.1
ATGGGACCGCTTCCAGAACTCCGGCCTAACCATCGTCCTGAAAAAAACTCGAAAAATAAAAGAAAGAGGGCTGGAATCTATACATTGATTCTTTTCTTCGCTGTTTTTTTTGAACCGTATGCATCAAAAGGTGCATGTACGGTTCCTAAGGGATACAATTTTACCCTACTCAACCGACTTTATCGAGAAAGATTACTTTTTTTAGGCCAAGAGGTTGATAGCGAGATCTCGAATCAACTTATTGGTCTTATGGTATATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018470
ATGGGACCGCTTCCAGAACTCCGGCCTAACCATCGTCCTGAAAAAAACTCGAAAAATAAAAGAAAGAGGGCTGGAATCTATACATTGATTCTTTTCTTCGCTGTTTTTTTTGAACCGTATGCATCAAAAGGTGCATGTACGGTTCCTAAGGGATACAATTTTACCCTACTCAACCGACTTTATCGAGAAAGATTACTTTTTTTAGGCCAAGAGGTTGATAGCGAGATCTCGAATCAACTTATTGGTCTTATGGTATATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803171.1
MGPLPELRPNHRPEKNSKNKRKRAGIYTLILFFAVFFEPYASKGACTVPKGYNFTLLNRLYRERLLFLGQEVDSEISNQLIGLMVYLSIEDETKDLYLFINSPGGWVIPGVAIYDTMQFVRPEVHTICMGLAASMGSFILVGGEITKRLAFPHAWVMIHQPASSFYEAQTGEFILEAEELLKLRETLTKVYVQRTGKPLWVVSEDMERDVFMSATEARAYGIVDLVAVE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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