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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001440`

染色体: Chr03 坐标: 17117103-17118739 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001440`
名称	SmilChr03G001440
描述	CSC1-like protein HYP1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17117103 - 17118739 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017909`
GeneID	`131017909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017909`
原始查询	`SmilChr03G001440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CSC1-like protein HYP1
产物	CSC1-like protein HYP1
Arabidopsis	`AT3G01100` (HYP1) - identity=63.3; qcov=0.966; evalue=4.71e-80; confidence=high
Rice	`Os12g0582800` (OsOSCA2.4) - identity=51; qcov=0.922; evalue=4.26e-56; confidence=high
GO	GO:0005227 (calcium-activated cation channel activity); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02714 (RSN1_7TM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802633.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057802633.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057802633.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057802633.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057802633.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17117467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C20
`Chr3:17117468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr3:17117532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C32,C68
`Chr3:17117532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:17117544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:17117545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:17117632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C76
`Chr3:17117648`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr3:17117648`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr3:17117664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B126
`Chr3:17117666`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A11,A13,A15,A16,A25,A6,A7,B101,B123,B126,B128,B137,B138,B22,B23,B24,B3,B33,B44,B49,B53,B54,B55,B63,B7,B80,B87,C11,C21,C32,C46,C58,C63,C67,C68,C69,C70,C71,C74,C80,C83,C86,D1,D10
`Chr3:17117677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802633.1

206 aa

103

206

RSN1_7TM

PF02714 RSN1_7TM 1-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802633.1`	Pfam	`PF02714`	RSN1_7TM	Family	1	203	5.7e-43	148.0	Calcium-dependent channel, 7TM region, putative phosphate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946650.1
TGCTGTTGTTTTTGCATGTCTTATTATAACCATTATGTTCATTGTACCTGTTTTCATAGCCCAAGGGCTTGCTAATTTGGCTCAGTTAGAGACCATGCTACCCTTTTTGAGCGGCATATTAAGGATGAAAATCGTTACCCAAGTGGTTACAGGATTTCTTCCGAGTCTCATCCTTGAGATGTTTTTAGTTTTAGTGCCACCAGTCATGATCATGCTTTCTTCCATTCAAGGACACGTTGCCCTTAGCCAGATTGAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017909
ATGTTCATTGTACCTGTTTTCATAGCCCAAGGGCTTGCTAATTTGGCTCAGTTAGAGACCATGCTACCCTTTTTGAGCGGCATATTAAGGATGAAAATCGTTACCCAAGTGGTTACAGGATTTCTTCCGAGTCTCATCCTTGAGATGTTTTTAGTTTTAGTGCCACCAGTCATGATCATGCTTTCTTCCATTCAAGGACACGTTGCCCTTAGCCAGATTGAGAAAAGTGCATGTATCAAAATGGTATGGTTCACCGTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802633.1
MFIVPVFIAQGLANLAQLETMLPFLSGILRMKIVTQVVTGFLPSLILEMFLVLVPPVMIMLSSIQGHVALSQIEKSACIKMVWFTVWNIFFANVLSGSALYKFNLLLEPKKIPELLAVVVPGQASFFIAYVVTSGWTTTFSTELFRLKFLVCRFLKGGMCCCSNEELEVLSNPYHRQIPRILFFSLLGITYFFLAPLILYLITLSQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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