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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001453`

染色体: Chr03 坐标: 17356648-17361096 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001453`
名称	SmilChr03G001453
描述	tRNA dimethylallyltransferase 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17356648 - 17361096 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017921`
GeneID	`131017921`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017921`
原始查询	`SmilChr03G001453`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA dimethylallyltransferase 2-like
产物	tRNA dimethylallyltransferase 2-like
Arabidopsis	`AT2G27760` (IPT2) tRNAisopentenyltransferase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817322] identity=57.4; qcov=0.88; evalue=4.77e-167; confidence=high
Rice	`Os01g0968700` (OsIPT9) - identity=51.2; qcov=0.931; evalue=8.88e-149; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006400 (tRNA modification); GO:0052381 (tRNA dimethylallyltransferase activity)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01715 (IPPT); PF01745 (IPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017921

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802645.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802645.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802645.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802645.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17356821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:17356871`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr3:17356871`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr3:17356913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:17358138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C45
`Chr3:17358139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr3:17359119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C72
`Chr3:17359176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B34,B86
`Chr3:17359954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B14,B33,B5,C2
`Chr3:17360682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr3:17360682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:17360694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802645.1

493 aa

246

493

IPT

IPPT

PF01745 IPT 25-68 aa PF01715 IPPT 59-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802645.1`	Pfam	`PF01745`	IPT	Domain	25	68	2.4e-05	24.6	Isopentenyl transferase
`XP_057802645.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	59	354	2.6e-53	181.9	IPP transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946662.1
AAGTTCAGACTATTAAGCCCAAAATGGATCAGCTCGGCCCATTTTATCCATCCTTCACTCACAATCTTATCAATTTATCGCCGGCGAATAGCCCTAGCGGCGGCGAGGCCGCGGCGCAAGCGCGATAATGGAGGCTACAAGCCCGCCCGAAGAGAAATCATCTGGCCATAATCCGAACAAGGGCCCGAATACAAAGCACAAAATCGTGGTGATAATGGGCGCTACGGGATCAGGCAAATCCAAATTGGCTATAGACCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017921
ATGGAGGCTACAAGCCCGCCCGAAGAGAAATCATCTGGCCATAATCCGAACAAGGGCCCGAATACAAAGCACAAAATCGTGGTGATAATGGGCGCTACGGGATCAGGCAAATCCAAATTGGCTATAGACCTTGCTTCTCACTTCCCCATTGAAATTATCAGTGCCGATTCCATGCAGGTTTATCAAGGGTTGGATGTTCTTACTAATAAAGTTCCTGCTCATGAGCAAAAAGGAGTTCCGCATCATCTGCTGGGGACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802645.1
MEATSPPEEKSSGHNPNKGPNTKHKIVVIMGATGSGKSKLAIDLASHFPIEIISADSMQVYQGLDVLTNKVPAHEQKGVPHHLLGTISPNVEFTAKDFRDSAIPLIDEICSRNRLPVLVGGTNYYIQALVSRFLLDDHAEDLEANCLMDTHGKKDICCFRFRPDIELEPPGEDCLYTYSRLKDLDPVAANRIHPNDQRKIKQYLTVYSHLGVLPSKLFQGNTMQNWGQADNLRYDCCFICVDASLLAMDLYVNQRVDVMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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