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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G001548

染色体: Chr03 坐标: 19492793-19497459 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G001548
名称SmilChr03G001548
描述uncharacterized SmilChr03G001548
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向19492793 - 19497459 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131018010
GeneID131018010
locus_tag-
NCBI NameLOC131018010
原始查询SmilChr03G001548

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述WRKY transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842718]; symbol=AT1G64140; hit=AT1G64140; species=arabidopsis; confidence=high
产物WRKY transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842718]; symbol=AT1G64140; hit=AT1G64140; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT1G64140 (AT1G64140)
WRKY transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842718]
identity=57.9; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
RiceOs01g0621900 (IIP1)
-
identity=57.3; qcov=0.915; evalue=0; confidence=high
GO-
KEGG-
PfamPF24906 (Zf_WRKY19)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131018010

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057802740.1
2 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057802740.1
3 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057802740.1
4 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057802740.1
5 Telomere 端粒 0.00000 XP_057802740.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr3:19495240 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B138
Chr3:19495400 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr3:19495588 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B94,C21,C72
Chr3:19496247 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr3:19496598 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B29
Chr3:19497098 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B108,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802740.1
658 aa
N
1
329
658
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
C
PF24906 Zf_WRKY19 258-281 aa PF24906 Zf_WRKY19 282-306 aa PF24906 Zf_WRKY19 307-331 aa PF24906 Zf_WRKY19 357-381 aa PF24906 Zf_WRKY19 382-406 aa PF24906 Zf_WRKY19 460-484 aa PF24906 Zf_WRKY19 485-509 aa
XP_057802741.1
658 aa
N
1
329
658
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
Zf_WRKY19
C
PF24906 Zf_WRKY19 258-281 aa PF24906 Zf_WRKY19 282-306 aa PF24906 Zf_WRKY19 307-331 aa PF24906 Zf_WRKY19 357-381 aa PF24906 Zf_WRKY19 382-406 aa PF24906 Zf_WRKY19 460-484 aa PF24906 Zf_WRKY19 485-509 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057802740.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 258 281 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802740.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 282 306 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802740.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 307 331 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802740.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 357 381 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802740.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 382 406 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802740.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 460 484 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802740.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 485 509 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802741.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 258 281 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802741.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 282 306 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802741.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 307 331 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802741.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 357 381 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802741.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 382 406 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802741.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 460 484 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain
XP_057802741.1 Pfam PF24906 Zf_WRKY19 Domain 485 509 1.4e-74 246.1 WRKY19 zinc finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057946757.1
TTTTTCATGTTAGGAGTGCATAATTAGAGGGGGATTAACATTAACCCCCTCAAAAAATATTAGAGGATCATTGTTGCTTAATTAGGTAAGACGGCTTAACCTGCGCCGTTTATTTGTAACCTGCGCCTGCCTCGTCGGTTGTCACTGTCCGTTGATTAATTTTCCGAAATTACTAAATTTCCCACAGTCACTGTTCATCGGTATATATACATTTACTTGAAAATCAGCAAAATCACACACACCTCTCTCTGTCCCCTTTT...
XM_057946758.1
TTTACTTGAAAATCAGCAAAATCACACACACCTCTCTCTGTCCCCTTTTCTATTACCTCGCCGGCGCTCACCAAGCCCTAGCTCTCCCTTTCTCTCTCATCCCCACACTCTCTATCTCTTTCTATAGATTCCGTAACTATACCCCGAGTTTTATTCTCCAGCTGAATTACCGATTAATTCCGACAAGCTTTGCTGAAGCTCTTTCCGCGTGCGTGTGTGTGTTTCCCTTTCTTCTGAAGCTGATTATTGATCTATCCCGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC131018010
ATGGATGCCAGATTCCACAATCTGGGTTCTGCTGCAAACCCTCAATCAGATGCGTTTAAGAATCTGTGCAATCCCATCCAAATCAGAGGAACTGGAGCCAAAGTTGTGTATTGTGCGGACACAACCCTACGACTTGATTCTCCTGGTCATGCAACCCCCTTTGCATCTGCTTCGAAGGGGGTGAAACGAAAGTGGAGTATTGATGATGATCCGGCAAATCAGCAAGGTGAATCTCTTCTATGTCTCCACCTTGGTCATTC...
LOC131018010
ATGGATGCCAGATTCCACAATCTGGGTTCTGCTGCAAACCCTCAATCAGATGCGTTTAAGAATCTGTGCAATCCCATCCAAATCAGAGGAACTGGAGCCAAAGTTGTGTATTGTGCGGACACAACCCTACGACTTGATTCTCCTGGTCATGCAACCCCCTTTGCATCTGCTTCGAAGGGGGTGAAACGAAAGTGGAGTATTGATGATGATCCGGCAAATCAGCAAGGTGAATCTCTTCTATGTCTCCACCTTGGTCATTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057802740.1
MDARFHNLGSAANPQSDAFKNLCNPIQIRGTGAKVVYCADTTLRLDSPGHATPFASASKGVKRKWSIDDDPANQQGESLLCLHLGHSSSSSDSKGSTATACTSMSSAKGTEEESSMDLELDFTLNLGGDKSSGVEKSASSCLESLNKWPKVNLQLSLSSRPAVSDITTIHPSSSVLENATKMVTDNGGLNTDEGSTGSPFFPLQSPLNEEKICFLDQLGPMKTASPGLSSSVITTPKSSVTCSSGITQLQQQRSSSTKQC...
XP_057802741.1
MDARFHNLGSAANPQSDAFKNLCNPIQIRGTGAKVVYCADTTLRLDSPGHATPFASASKGVKRKWSIDDDPANQQGESLLCLHLGHSSSSSDSKGSTATACTSMSSAKGTEEESSMDLELDFTLNLGGDKSSGVEKSASSCLESLNKWPKVNLQLSLSSRPAVSDITTIHPSSSVLENATKMVTDNGGLNTDEGSTGSPFFPLQSPLNEEKICFLDQLGPMKTASPGLSSSVITTPKSSVTCSSGITQLQQQRSSSTKQC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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