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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001771`

染色体: Chr03 坐标: 24175088-24176313 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001771`
名称	SmilChr03G001771
描述	uncharacterized SmilChr03G001771
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24175088 - 24176313 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018558`
GeneID	`131018558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018558`
原始查询	`SmilChr03G001771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0513700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0513700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G43260` (AT1G43260) hAT transposon superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840927] identity=30.7; qcov=0.544; evalue=6.99e-26; confidence=low
Rice	`Os02g0513700` - identity=48.2; qcov=0.963; evalue=5.02e-117; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02892 (zf-BED); PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803255.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803255.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803255.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803255.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803255.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24175164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B102,B11,B120,B140,B44,B72,C14,C59,C77,C85
`Chr3:24175257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C31
`Chr3:24175283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B41
`Chr3:24175332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C31
`Chr3:24175446`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B127,B14,C49
`Chr3:24175446`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B127,B14,C49
`Chr3:24175504`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B70,C78
`Chr3:24175504`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B70,C78
`Chr3:24175616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B108,B123,B46,C23
`Chr3:24175771`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C15
`Chr3:24175771`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C15
`Chr3:24175788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803255.1

377 aa

188

377

zf-BED

DUF659

PF02892 zf-BED 27-67 aa PF04937 DUF659 204-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803255.1`	Pfam	`PF02892`	zf-BED	Domain	27	67	2.8e-05	24.8	BED zinc finger
`XP_057803255.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	204	365	2.2e-46	157.9	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947272.1
ATGAATTCTTCAAGTTCTGTTCATGCTGATGGTGATACAAATGAAAATGATAATGAGAAGGAGAGTTCTAGTTGTTGGCCTTTGTGGAAATATGTAGAGAAGCAATCGAAAATTGGTAAAGGGGGTGGAAATACAAAATTTAAATGTATGTATTGTAAAAATGTGTATACTGGGTCTTACTCAAGATTGAGGAATCATTTGTTGAAAAATTCTGGTATGGGAATTACCATATGCCATAAAGCTACTGTTGCCAATGTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018558
ATGAATTCTTCAAGTTCTGTTCATGCTGATGGTGATACAAATGAAAATGATAATGAGAAGGAGAGTTCTAGTTGTTGGCCTTTGTGGAAATATGTAGAGAAGCAATCGAAAATTGGTAAAGGGGGTGGAAATACAAAATTTAAATGTATGTATTGTAAAAATGTGTATACTGGGTCTTACTCAAGATTGAGGAATCATTTGTTGAAAAATTCTGGTATGGGAATTACCATATGCCATAAAGCTACTGTTGCCAATGTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803255.1
MNSSSSVHADGDTNENDNEKESSSCWPLWKYVEKQSKIGKGGGNTKFKCMYCKNVYTGSYSRLRNHLLKNSGMGITICHKATVANVLEMSKMEEQASSKRDAVKIKDIPLPRSVCDSVGSFSVTMTEVEPSSFKLEGYDPLKKRKIVDGPLGKAFNAQAREILDGEIARMFYSAGLPFNLAKNPHFIKSYSLAANSNVAGYNPPGYNALRTKLLKNERSHLQTLLEATKSTWKSKGVTIVCDGWTDPQRRPLINFMAINE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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