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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001857`

染色体: Chr03 坐标: 25615113-25623695 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001857`
名称	SmilChr03G001857
描述	uncharacterized SmilChr03G001857
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25615113 - 25623695 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013925`
GeneID	`131013925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013925`
原始查询	`SmilChr03G001857`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0504600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0504600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G43180` (AT2G43180) Phosphoenolpyruvate carboxylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818919] identity=65.3; qcov=0.901; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0504600` - identity=63.3; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF00463 (ICL); PF13714 (PEP_mutase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797833.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057797833.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797833.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797833.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25615371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B48,C45,C54
`Chr3:25615406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:25618224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,C24,C42,C6
`Chr3:25618761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:25618820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B64,C24,C42,C6
`Chr3:25621097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B129,B132,B2,C12
`Chr3:25622534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C28,C74
`Chr3:25622613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797833.1

467 aa

234

467

PEP_mutase

ICL

PF13714 PEP_mutase 56-302 aa PF00463 ICL 125-214 aa

XP_057797834.1

467 aa

234

467

PEP_mutase

ICL

PF13714 PEP_mutase 56-302 aa PF00463 ICL 125-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797833.1`	Pfam	`PF13714`	PEP_mutase	Domain	56	302	6e-46	157.7	Phosphoenolpyruvate phosphomutase
`XP_057797833.1`	Pfam	`PF00463`	ICL	Domain	125	214	9.4e-13	48.2	Isocitrate lyase family
`XP_057797834.1`	Pfam	`PF13714`	PEP_mutase	Domain	56	302	6e-46	157.7	Phosphoenolpyruvate phosphomutase
`XP_057797834.1`	Pfam	`PF00463`	ICL	Domain	125	214	9.4e-13	48.2	Isocitrate lyase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941851.1
CACACTAGATTGAGGGATGGATAAAGGATCCCATATGCTAGGCTTGCTAGCCCACATTGCGGGTAAACAAAGTGTAGCAGGTTTTGTGAAGAAGTAGAGGTAGCAGCTAGCGGGGAGATATGGGCTTCTCAATTTCCTCCAATCCAGAATCCTTCCATCTCACGGCTAGAAGTTTTCATCCTAACATTTGTACAACAAGCTCCTCAAATCGTCGCTCAATCATCACCTTTTCATATCGCCACCCAGGCGCTGACGACGGC...

XM_057941850.1
CACACTAGATTGAGGGATGGATAAAGGATCCCATATGCTAGGCTTGCTAGCCCACATTGCGGGTAAACAAAGTGTAGCAGGTTTTGTGAAGAAGTAGAGGTAGCAGCTAGCGGGGAGATATGGGCTTCTCAATTTCCTCCAATCCAGAATCCTTCCATCTCACGGCTAGAAGTTTTCATCCTAACATTTGTACAACAAGCTCCTCAAATCGTCGCTCAATCATCACCTTTTCATATCGCCACCCAGGCGCTGACGACGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013925
ATGGGCTTCTCAATTTCCTCCAATCCAGAATCCTTCCATCTCACGGCTAGAAGTTTTCATCCTAACATTTGTACAACAAGCTCCTCAAATCGTCGCTCAATCATCACCTTTTCATATCGCCACCCAGGCGCTGACGACGGCGCCACCACCGCAGCAGAGTCCCTCAGACGACTTCTGCGTGCTCCGGGAGCTCACCTCGGCCCAGCTTGTTTCGACGCATTGAGCGCCAAGCTTGTCCAGCGTGCTGGTTTCGATTTCTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797833.1
MGFSISSNPESFHLTARSFHPNICTTSSSNRRSIITFSYRHPGADDGATTAAESLRRLLRAPGAHLGPACFDALSAKLVQRAGFDFCFTTGFGISASRLGLPDTGLISYGEMVDQGQQITGAVSIPIIGDADNGYGNPMNVKRTVRGYIRAGFAGLILEDQVSPKACGHTQGREVISREEAIMRIKAAVDARKESGSDIVIVARTDSRQAVSLQESLWRARALGNAGADVLFIDALASREEMEAFCEVCPQVPKMANMLE...

XP_057797834.1
MGFSISSNPESFHLTARSFHPNICTTSSSNRRSIITFSYRHPGADDGATTAAESLRRLLRAPGAHLGPACFDALSAKLVQRAGFDFCFTTGFGISASRLGLPDTGLISYGEMVDQGQQITGAVSIPIIGDADNGYGNPMNVKRTVRGYIRAGFAGLILEDQVSPKACGHTQGREVISREEAIMRIKAAVDARKESGSDIVIVARTDSRQAVSLQESLWRARALGNAGADVLFIDALASREEMEAFCEVCPQVPKMANMLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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