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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002207`

染色体: Chr03 坐标: 34772643-34776230 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002207`
名称	SmilChr03G002207
描述	probable WRKY transcription factor 33
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	34772643 - 34776230 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016433`
GeneID	`131016433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016433`
原始查询	`SmilChr03G002207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 33
产物	probable WRKY transcription factor 33
Arabidopsis	`AT2G38470` (WRKY33) WRKY DNA-binding protein 33 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818429] identity=64.4; qcov=0.64; evalue=2.89e-130; confidence=high
Rice	`Os01g0826400` (OsWRKY24) - identity=50.2; qcov=0.89; evalue=1.64e-123; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801109.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801109.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801109.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801109.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:34772912`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C66
`Chr3:34772912`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C66
`Chr3:34773356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:34773389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C33
`Chr3:34774969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B99,C26
`Chr3:34774984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B38,B39
`Chr3:34775083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B33,C23,C72
`Chr3:34775149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:34775172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B117
`Chr3:34775174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:34775310`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr3:34775310`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801109.1

544 aa

272

544

WRKY

PF03106 WRKY 222-278 aa PF03106 WRKY 385-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801109.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	222	278	2e-52	176.0	WRKY DNA -binding domain
`XP_057801109.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	385	442	2e-52	176.0	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945126.1
AAGCTCAAAGACTTCTCTTCCTTCTCCAAAATTCTTCATTTGATTTATTTATATATATTTTTTCCCTTCACCCTCCAACGCTTTCTAACTCATTTCTCCAATTTTTGCCATTCATTCCAACACCAATCTCCCCCAAAAAAAAAAGTAAAAAAAAAATGGCTTCTTCTAGCGGAAGCTTAAACGCTTCTGCTAATAATTCGAATCACCATATGTTTTCTTCATCACAGTACATGTCTACTTCTTTCACTAATCTTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016433
ATGGCTTCTTCTAGCGGAAGCTTAAACGCTTCTGCTAATAATTCGAATCACCATATGTTTTCTTCATCACAGTACATGTCTACTTCTTTCACTAATCTTCTCTCTCCCAACAAACAAGGAGAGGAAGAAGAAGAAGACGCCATGAGCCGACCAAGATCTCGTTTCAGTTGGGGAATGAATTCAGACATAGTTAACAAGAACATCGAAATCCCAAAATACAAGTCTTTCCCACCTTCCTCTTTGCCTCTCTCTCCTCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801109.1
MASSSGSLNASANNSNHHMFSSSQYMSTSFTNLLSPNKQGEEEEEDAMSRPRSRFSWGMNSDIVNKNIEIPKYKSFPPSSLPLSPPPVSPSSYLSIPPSLSPSILLDSPVLFSSSNVLPSPTTGSFAAKEEERKYSDFSFQSHSMFPSSAGLNRMDSYRREQDHENFNSFINKQAEFPTTKSLPKAEQHSFSQDFPIHGGDQAPQQPYPQQSQYVREQRKSDDGYNWRKYGQKQVKGSENPRSYYKCTFPNCPTKKKVER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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